明前期国土辽阔，东起日本海、外兴安岭，南抵孟加拉湾、越南中部、马来西亚，北达戈壁沙漠、大兴安岭，西至印度次大陆、极盛国土面积达约一千万平方公里。
一、北方
明朝前期，多次对北元和随后的鞑靼和瓦剌作战，并在与漠南一带设置四十余个卫所防卫，包括东胜卫、云川卫、官山卫、全宁卫、老哈河卫等，这些都是明廷的边防重地。其走向大致为阴山-大青山南麓-西拉木伦河一线。
15世纪30年代后，由于天气转寒，农耕不济，靖难之役时边塞军队被燕王抽调。因此期间边境略有南移。
在明成祖永乐年间，明军多次北伐，边境形势一度改观。但在明中叶以后，随着蒙古的再次崛起，边境再次南移。并修建边墙以防御蒙古，在长城沿线设置九边（辽东、蓟州、宣府、大同、延绥、宁夏、甘肃、太原、固原）重镇加强防御。长城也成为明中后期的北边，同时也是农耕区与游牧区的界线。
二、东北
明太祖朱元璋设置辽东都司以经营辽东。并多次进军黑龙江流域，招抚当地土著部落，势力一度抵达大兴安岭、松花江流域。明成祖永乐七年（1409年）设奴儿干都司，下辖130多个卫所，将东北疆扩充至外兴安岭、库页岛等地，后在明宣宗宣德九年（1434年）废弃，共持续25年。
但原设于此处的各卫所及辽东都司仍然存在，至万历年间东北羁縻卫所增至384个。明英宗正统年间后，鞑靼兀良哈与建州女真部南迁，并不断侵犯辽东都司。明宪宗成化五年（1469年），明廷修建辽东边墙。
16世纪末开始，建州女真酋长努尔哈赤开始兴起，统一女真部，明廷设置的卫所逐渐消亡。明神宗万历四十四年（1616年）努尔哈赤称汗，建立后金。明神宗万历四十七年（1619年）萨尔浒之战后，后金军队破辽东边墙，占领辽东都司大部土地。
三、西北
明太祖洪武年间，西北疆界达到今新疆东部哈密地区，并设置一系列卫所。15世纪30年代之后，西北吐鲁番与青海蒙古部日益强大。
1472年，哈密卫城一度被吐鲁番攻破，卫内迁，后复，1514年再度被并。15世纪后半期后，西北诸卫全部丧失，明军退守嘉峪关。
五、西藏
1368年，明朝取代元朝，采用收缴元朝旧敕旧印，换发明朝新敕新印的形式和平过渡，继承了对西藏地方的国家主权。在行政区划与军政机构设置上，明朝在西藏基本上承袭了元朝的划置方式。在元代乌思藏宣慰司、朵甘宣慰司故地，明朝设立乌思藏、朵甘两个卫指挥使司和俄力思军民元帅府。
后来，又将乌思藏、朵甘两个卫指挥使司升格为行都指挥使司，其下设指挥使司、宣慰司、招讨司、万户府、千户所等机构。
各级军政机构的官员，均封委当地的僧俗首领出任。各级官员之任免、升迁，概由明朝中央直接决定，并颁授印诰等。
六、西南
明太祖洪武十四年（1381年），明朝才将西南地区完全划入疆域。并设置一系列土司、宣慰司管辖之，边界达到缅甸中北部、老挝北部、泰国北部一线。后期这些地区多被周边国家所并。
明成祖永乐四年（1406年），明军进攻安南，南线达到日南州一带。次年设置交趾布政使司，下设十五府、卅六州、两百余县。
后因当地人民反抗激烈，明廷于明宣宗宣德二年（1427年）放弃，安南恢复黎氏王朝。
七、澎湖与澳门
明朝前期，设澎湖巡检司管理澎湖列岛和台湾本岛。 1553年葡萄牙获得在澳门停泊船只权，至1557年获得居留权，葡萄牙人要向明政府交付租金，明廷依然拥有澳门主权。
八、海疆
明永乐十五年（1405年），明成祖在吕宋岛设吕宋总督。
