公元1361年正月初一，小明王韩林儿封朱元璋为吴国公。江南行中书省设置御座，尊奉小明王韩林儿画像，让各路文官武将都去行庆贺大礼。朱元璋率百官都去参拜，手下人都到齐了，唯独不见刘基。
李善长派人去请，还是不见影子。再请，这位以往不怎么发脾气的军师却生气了，十分恼怒地说道：“他不过是一个放牧的毛孩子，尊奉他干什么？”始终拒绝向韩林儿行参拜之礼。
事后，朱元璋召刘基问道：“今天怎么不见先生？”
刘基道：“当今天下，唯主公为群雄之首；将来天下，唯主公为真龙是主，此乃天命也，我何必去拜一个毛孩子？”
朱元璋听后，顿时醒悟，大为感动，同时也增强了他彻底消灭陈友谅的决心。
当初，张士诚派吕珍围困安丰，小明王宋朝廷告急，刘福通两次派使求救，朱元璋准备率军出征解围，刘基却坚决反对。
第一个理由是劳师远征，部队鞭长莫及，即使赶到安丰，城已被破，得不偿失；第二个理由是担心陈友谅趁后方空虚，攻占应天。
除此之外，刘基还有一个非常重要的问题，问过朱元璋：“主公此去，目的在何？”
朱元璋答道：“小明王被围甚急，我岂能袖手旁观？再者，安丰失守，张士诚的力量就会更加强大，不可不救。”
刘基分析完当时的整个战局后，说出一句非常关键的话：“且不说小明王该不该救，如若救出来，主公以为当发往何处？”这才是刘基心中最重要的一个问题。
是啊，你朱元璋不是整天想的是谋取天下，成就大业吗？既然如此，何必还去管那有名无实的小明王呢？即使你冒险这次救出他来，将夹又如何处置？把他关起来杀掉吗？那又何必去救他！世人又是如何对你评价呢？如果继续让他做皇帝，那你打败元朝皇帝，又有一个宋朝皇帝，岂不是自捆手脚、作茧自缚吗？
因此，无论从眼前着想，还是从图谋大汁，刘基都认为朱元璋都是不应该去解安丰之围的。
但朱元璋还是去了，他的真实思想是什么？不得而知。但刘基知道，他有两个症结。
一个是朱元璋率部与陈友谅作战两次，虽然取得胜利，但这陈友谅看来不好对付，朱元璋想先解决张士诚，他不愿看到张士诚又发展为第二个陈友谅。对这一点，刘基是可以理解的。
还有一点，既是朱元璋的致命弱点，又是将来要给自己添麻烦的问题。就是既不愿受制于人，从内心不愿意把自己的旗帜挂在小明王的麾下，早就存了离之而去之心，但又摆脱不了世俗的东西，担心后人说自己大仁不义。
这后一点，刘基看得非常之准，也非常之远久。他认为，要为人君，天之骄子，当断不断，必受其乱。
后来发生的事也证明刘基的认识是正确的，朱元璋想落一个正人君子的名声，却留下了谁最后杀死小明王的永世疑问。
刘基准备下定决心尽早解决这个问题。他自从投入朱元璋门下之后，就从来没有给朱元璋出过与小明王接触的主意，为朱元璋出的所有军事谋略、战略部署、作战行动，也从来没有报告给这个宋朝廷知道。他对小明王只是利用，利用其作为抵御元朝廷的一块挡箭牌。
其实，朱元璋又何尝不是呢？只是他想做得高明一点。
对此，小明王也是心中有数的，只是他虽为皇帝，手下却没有一兵一卒。当时一切权力在刘福通手中，后来又受制于朱元璋。
安丰之围后，朱元璋将小明王韩林儿安置到滁州。小明王非常担心，他知自己目前片瓦皆无，要不是朱元璋救下自己，恐怕连眼下这块立锥之地也没有，便问皇后说：“我今日徒拥帝号，已无权无兵，朱元璋为什么还要救我？”
皇后说：“他要你做他手中的一枚棋子。”
韩林儿说：“那还不如把这个帝号让给他算了。”
皇后道：“陛下错矣。朱元璋不顾风险，发大兵解安丰之围，要就是要的你这个帝号。他能理直气壮地与元朝廷抗衡，消灭其他势力。若陛下将此帝号让与他，无此名位，则危在旦夕。”
韩林儿又道：“要若杀我、朱元璋现在实力雄厚，独霸一方，即可动手，为何缺了名份则危矣？”
皇后道：“陛下说的有理，但目前尚不是时机，朱元璋面对众敌，既有元朝廷，又有陈友谅、张士诚等霸主与其相争，若不顾名节，现在动手除掉你，将落下口实、自毁前程。”
“那我该怎么办？”
“以君臣之礼相待，为其加封，静候其变。”
“也只好如此了。”
于是，当朱元璋作为人臣第一次与这位自己旗帜上的皇帝见面后，小明王即下诏，封赠朱元璋三代高官显爵。
虽然朱元璋在安丰城接到诏书时付之一笑，心想这韩林儿还不算蠢，但他照旧供奉其为自己的“皇帝”，临时建造宫殿，把皇宫里的宦官、侍卫都换上自己人，对韩林儿供养极厚、防护极严。
也就是说，小明王名为皇帝，其实是俘虏，受朱元璋监护。叱咤一时的红巾之主，就这样找到了自己的归宿。
