岳飞挥军进至朱仙镇后， 宋高宗赵构连发12道金牌催促其撤军，岳飞无奈下令岳家军班师，回撤至襄阳 。
岳飞痛惜前功尽弃，常感愤懑不平，于是常常对宾客叹息，又将恢复中原的大业作为自己的责任，不愿附和高宗、秦桧的议和主张。
一日，岳飞偶读秦桧奏章，厌恶他的乞和言论，也很憎恨他欺骗朝廷， 愤怒地对左右说：
此话大意是：君臣之间最大的人伦道德，根源于天性，身为大臣怎能忍心当面欺骗他的君主呢？
岳飞说这番话时大概没有想到，秦桧的议和言论正是高宗赵构的本意，他不过是赵构投降主义的具体执行者。
秦桧也因为岳飞极力阻止议和，凭他的能力和影响力，终究会阻挡与金媾和成功，到时候自己也会招致祸殃，所以极力想除掉岳飞。
谏议大夫万俟卨和岳飞有私人恩怨，于是秦桧暗示他捏造事实弹劾岳飞，又唆使心腹、中丞何铸、侍御史罗汝辑罗织所谓罪状，联名上书奏劾岳飞，大概是说：
大意：今年春天金军大举进攻淮西，岳飞奉命率军进援，进至舒、蕲一带就不再前进，勾结张俊部在淮上按兵不动，又打算放弃山阳而不加守御。
心灰意冷的岳飞多次奏请朝廷免去他的枢密使权柄，随后又将节制两镇军权的符节交出，充任有名无实的万寿观使、定期朝见高宗。
秦桧没有达到陷害岳飞的目的，就勾结嫉妒岳飞之功的另一抗金大将张俊，联手攻讦、迫害岳飞。张俊用手握把柄胁迫岳飞麾下第一重将王贵与其同流合污，又威逼利诱另一员岳家军裨将王俊诬告岳飞爱将张宪欲图谋不轨，以彻底削夺岳飞军权。
随后，秦桧下令逮捕岳飞父子以证实张宪“谋反”之事，见缉捕使者到来，岳飞坦荡地笑着说：
秦桧令其亲信、中丞何铸负责审理岳飞一案。何铸，字伯寿，浙江馀杭（今杭州）人。进士出身，致仕后先后任秘书郎、监察御史、御史中丞等职。史载，何铸禀性正直，品格高尚，为人骨鲠刚直。秦桧任宰相后，对何铸加以笼络，倚为亲信。
秦桧让何铸担任“岳飞专案组”组长，授意他严刑逼供，用酷刑拷问岳飞，逼他承认与张宪暗室密谋，铤而走险举兵“谋反”之事。何铸虽被秦桧收为心腹，但他并非无耻小人，心中是非自有判断。
起初何铸审问岳飞时，岳飞坚不承认有“谋反”企图，还扯开衣裳露出后背给何铸看，背后刺有“尽忠报国”四个大字，墨痕已深深地印进了皮肤里。何铸看后大为震撼，同时很感动。随着案件的深入审理，何铸找不到任何岳飞悖逆之罪证据，愈发感到此事的荒谬，于是找秦桧汇报说岳飞无罪，实属冤案。
秦桧大怒，撤掉了何铸的专案组组长之职，改命其死党、谏议大夫万俟卨负责此案。万俟卨与岳飞不睦，又是个阴狠恶毒、睚眦必报的小人， 遂无中生有诬陷道：
此话大意：岳飞给张宪写信，命令张宪虚张声势申报军情以震动朝廷，岳云也写信告诉张宪，令张宪安排能使岳飞回军（不愿进援淮西宋军）；而且声称这些往来书信已经烧毁。
岳飞在大理寺监狱中蹲了两个月，饱受拷虐，却咬死不认罪，万俟卨没有得到任何他“谋反”的罪证。有人暗示万俟卨以淮西之事为借口构陷岳飞，万俟卨茅塞顿开，高兴地对秦桧说，曾有文书下至岳飞府里，取走了高宗的亲笔手札藏匿起来以消灭证据。
秦桧大喜，唆使万俟卨逼迫岳家军裨将孙革、董兴等人作伪证证明岳飞是接到过朝廷诏书，拖延逗留，徘徊不进，还令评事官元龟年按照当时岳家军行军的时间、路线进行会审来定案。一直审到当年年底，因漏洞太多，案子仍然定不下来。
直到除夕的前一天，在高宗的授意下，秦桧亲笔写了一张纸条，命人送进大理寺狱 ，很快得到报告说岳飞已经死去，岳云、张宪被处决并曝尸街头。
据记载，临刑前，岳飞索笔在供状上写下“天日昭昭，天日昭昭”八个大字。岳飞死时39岁。随后，岳飞家里被抄，妻子李氏和几个子女被发配到岭南。
起初，岳飞还在大理寺狱中，大理寺丞李若朴、何彦猷 、薛仁辅等人都觉察到了冤情，都说岳飞无罪，全被万俟卨弹劾而丢了官职。为岳飞鸣冤的宗正卿士寰 、学士刘允升均被万俟卨迫害致死。凡是附和秦桧、万俟卨、张俊做成这件冤案的，都得到不同程度的升迁。
何铸被秦桧冷遇后，曾经呼吁免除岳飞死罪。但宋高宗赵构坚持重判。岳飞死后，何铸因反对与金议和，被降职为秘书少监，还被逐出临安，贬谪到徽州。 后起用为温州知府。他曾婉拒朝廷任命其为端明殿学士提举一职，并出使金国，回来后出任资政殿学士，不久迁调徽州知府。半年后，提举江州（今九江）太平兴国宫。卒于1152年，年65岁。
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