大部分史书记载，建文帝死于宫火。《明实录》和《太宗实录》都是一手货源。他们最接近“荆南之战”，而张廷玉修的♬也同意死在火言中。《神宗实录》年，建文帝又跑了出来，剃了头出家，周游列国。万历小皇帝突发奇想，向恩师张居正打听建文帝下落。张居正告诉他，建文帝在大火中逃亡，剃发出家。
《太宗实录》据记载，朱棣是这样说的：“我寻遍宫中寻找汉高臣，也没有找到。听说建文自焚时，印章都被毁掉了，我深感悲痛。”连玉玺和建文的尸体都没有找到。朱棣的意思是将他们烧死，但找不到证据。朱棣还特意清宫三天，就是为了找到建文的尸体和玉玺，后来又发现了一具烧焦的尸体，无法辨别。这让后人对建文的行踪十分怀疑，于是各种猜测接踵而至。朱棣攻入南京后，嚎啕大哭，以皇帝的礼仪安葬了建文。
这个时候，建文帝是死是逃都无所谓了。重要的是建文帝必须死，否则朱棣继位就麻烦了。
建文的下落之谜，后来越发扑朔迷离。很多方面都说建文帝逃生兴盛。直到现在，还有很多人用合理的证据证明自己是建文的后裔。很多历史学家也可以举例说明建文并没有死。他先跑出家出家，后改名改姓，安身立命。
还有一点也指向建文帝，那就是郑和下西洋。很多人猜测，朱棣此举是为了让郑和出海寻找建文。这种方法是不可靠的。郑和下西洋，为了找到建文帝，耗费了多少资源？显然不是，朱棣的主要目的是张扬国家威信，让世界知道明朝的强大，让周边国家前来进贡。为了表明自己的名声传遍海外，连找建文也只是顺带。
我个人认为建文帝早就死在火中了。朱棣虽然打着“清帝之侧”的名头，但如今已经到了这种地步，想当皇帝的人都没有了。
只要建文还活着，对朱棣就是威胁。毕竟，建文是朱元璋的合法继承人，是已经向世人宣布的皇帝继承人。朱棣是逆臣奸臣，不能自圆其说。如果建文带着传国玉玺逃走，对朱棣的威胁可想而知。
火可能是朱棣放的。他放出烟雾弹说是建文亲手放火烧了皇宫，然后弄了一具不明真相的尸体。为了掩盖事实，他们还散布谣言，说是在寻找建文的下落。真正的建文其实已经死了，朱棣是绝对不会允许建文活着的，因为建文的性命对朱棣的威胁太大了。建文是太祖的继承人，朱棣再有理智，也会篡位。如果让建文逃走，他知道对朱棣的影响有多大。在朱棣看来，只要一天找不到建文，朱棣就可以当一天皇帝，所以建文死在南京还是比较靠谱的，人们是永远找不到他的。
