751年，阿拉伯人巩固了对河中地区的统治，这使一个世纪之后的伊朗民族大受其益。阿拉伯总督认为，把蒙古人和当时还是非伊斯兰教徒的突厥这两大威胁从河中地区消除之后，他们便是在哈里发（继任伊斯兰教国家政教合一领袖的人）的名义下，为了自己的利益而工作。
然而，从850~875年，由历中上的古粟特人后裔组成的本地伊朗人，逐渐从阿拉伯人手中接过了统治布哈拉和撒马尔罕的权力，由此而形成了由纯伊朗人组成的萨曼王朝。
875~999年，萨曼王朝以布哈拉为首都，成为河中地区的统治者。至于这种统治权力的转移，并非经过了暴力或者革命，而是发生在哈里发的内部机构。萨曼王朝表面上谦虚地满足于“埃米尔”（意为“受命的人”“掌权的人”）称号，假装充当着巴格达哈里发的代表。然而事实上，依照所有事情的进展来看，他们又好像是完全独立的，他们的主张表明：在非正统的伊斯兰教外壳下，实现伊朗民族国家的复辟才是其真正的目标。
萨曼王朝的真正建立者是纳斯尔•伊本•阿赫穆德。874~875年间，阿拉伯哈里发穆塔米德把河中地区赏赐给纳斯尔作为封地，纳斯尔以撒马尔罕作为驻地。随即，他把自己的兄弟伊斯迈尔任命为布哈拉的“瓦利”，即总督。885~886年，纳斯尔与伊斯迈尔之间爆发冲突，这在当时的河中各王朝统治者内部是极为寻常的。892年，纳斯尔逝世，伊斯迈尔一统河中全境，布哈拉也顺理成章地成为萨曼王朝的新都城。
伊斯迈尔•伊本•阿赫穆德(892~907年在位）是萨曼王朝一位伟大的君主。900年春季，伊斯迈尔亲自率兵，在巴尔赫附近一带彻底击败了呼罗珊的萨法尔王朝（867年建立于波斯东部的伊斯兰教封建割据王朝），俘虏了其君主阿马尔•伊本•埃勒斯，并占领和吞并了呼罗珊全境，使伊朗的国土扩大了一倍。
902年，伊斯迈尔又对另一个王室发起战争，把包括剌夷（今德黑兰）和加兹温在内的塔巴里斯坦据为己有。从893年开始，伊斯迈尔对位于东北部突厥地区的怛罗斯发动了一场旷日持久的战争。
在他攻占了怛罗斯之后，就立即把当地的一座名叫聂思托里的基督教教堂变成了清真寺。此次远征中，伊斯迈尔还夺得了突厥游牧民大量的马、羊、骆驼等战利品。
在这场战争中，他又回到了古代萨珊国王们所遵循的防御性反击策略。这次战争也被称为波斯人对突厥世界的伊斯兰战争。处在边境地区的这些突厥游牧部落，在逐渐皈依伊斯兰教之后，其面对的冲突形势才变得缓和起来。萨曼王朝为改变突厥游牧部落的宗教信仰所进行的努力，却为自己未来的衰落与灭亡埋下了伏笔。因为萨曼王朝的这种努力，使伊斯兰穆斯林社会向突厥人敞开了大门，也使不少突厥首领把进入伊斯兰社会当作也们最终取代萨曼王朝的第一步。
纳斯尔二世统治时期（914~943年），萨曼王朝的疆域达到了鼎盛时期：北至 塔什干，东北至费尔干纳，西南至剌夷，甚至远至喀什噶尔都在它的实际控制范围之内。但是，纳斯尔二世转而信奉伊斯兰教什叶派的举动，引发了当时河中地区狂热信奉伊斯兰教逊尼派的伊朗教徒的严重骚乱，最后导致他被迫退位。
努赫一世统治时期，萨曼王朝开始走向衰落。伊朗军事贵族不断地挑起反
叛，同时，萨曼王朝逐渐对另一个伊朗王朝--统治波斯西部的布威王朝产生敌视，两个王朝之间的冲突因宗教信仰的不同而加剧。
萨曼王朝信奉的是逊尼派，而布威王朝信奉的是什叶派，但是，宗教的分歧只是借口，战争的实质是都想争夺剌夷城。这场战争使萨曼王朝抵御突厥人的力重受到了严重的削弱，而且影响到了伊朗内部的历史，当时，因为不少突厥人集体皈依了伊斯兰教，并且成为了河中地区的雇佣军，从而使伊朗各重镇的钥匙转入了这些突厥人的手里。
阿布德•阿尔﹣马立克一世统治萨曼王朝时，一位名叫阿尔普特勤的突厥奴隶被提拔为王朝卫队的统帅，后来又被任命为呼罗珊总督。
但是不久之后，却遭到了继任萨曼王的曼苏尔一世的罢免。阿尔普特勤逃到巴尔赫城，在萨曼王朝军队的攻击下，又于962年退出巴尔赫，逃到阿富汗的伽色尼（即加兹尼）城。最后阿尔普特勤及其家族靠着承认萨曼王朝的宗主权，在加兹尼建立了自己的伽色尼王朝，这是信奉伊斯兰教的伊朗境内建立的第一个突厥人的国家。
963年，阿尔普特勤去世。977年，阿尔普特勤在加兹尼一手创建的突厥雇佣军被另一名前突厥奴隶赛布克特勤统率。赛布克特勤成为吐火罗地区和坎大哈的君主，并开始征服喀布。
当萨曼王朝处在努赫二世统治时期时，由于伊朗军事贵族闹独立，王朝内部已经四分五裂。992年，贵族阿布•阿里向位于楚河河畔的巴拉沙衮城内的哈拉汗朝统治者博格拉汗•哈仑求援，以期望联合对抗努赫二世。博格拉汗率军远征，于同年5月攻入萨曼王朝都城布哈拉，但他并不想留在该城。为了抵抗阿布•阿里的叛乱和哈拉汗朝的进攻，努赫二世向伽色尼王朝的赛布克特勤王求救。
995年，精明的赛布克特勤率军从伽色尼出发，以保护萨曼王朝的名义占据了呼罗珊。就这样，萨曼王朝的疆域只剩下了河中地区，而该地区的两侧各有一个虎视眈眈的觊觎者：一是阿富汗和呼罗珊的主人一一伽色尼突厥王朝，一是统治着楚河草原、伊犁河流域、喀什噶尔的哈拉汗王朝。不管怎样，萨曼王朝是气数将尽了。
999年5月，赛布克特勤的儿子马赫穆德在莫夫附近打败了刚继位3个月的萨曼王朝君主马立克二世，迫使其永久地放弃了呼罗珊。同年10月，哈拉汗朝君王阿尔斯兰•伊列克•纳斯尔率军进攻河中地区，攻占了布哈拉，马立克二世被俘，萨曼王朝宣告灭亡。
就这样，整个伊朗王国被两个信奉伊斯兰教的伊斯兰突厥王朝瓜分：河中地区并入了喀什噶尔的哈拉汗朝的版图，呼罗珊地区则成了阿富汗的伽色尼王朝的疆域。
