1380年10月1日，朱亮祖与长子朱暹在狱中暴亡。当家人看到他的尸体时，发现他遍体鳞伤，后背也已皮开肉绽。即使让一个普通人来看，都会怀疑朱亮祖受到了残酷的刑罚。
朱亮祖死后，朱元璋草草地为他举办了葬礼。在葬礼上，朱元璋竟对朱亮祖的次子朱昱说道：“你父兄欺行霸市，滥杀道同，如今亡于鞭下，也算死有余辜了。”那么，朱亮祖是不是如朱元璋所说的那样“死有余辜”呢？他又为何会走上作茧自缚的道路？他的死因究竟是什么呢？
“降而复叛”的勇将
朱亮祖，祖籍安徽六安。元末天下大乱，朱亮祖组织乡民抵抗散兵游勇。不久后，战绩卓著的朱亮祖受到朝廷青睐，赐封他为义兵元帅，专职守卫宁国，防备红巾军。
1356年，朱元璋南下攻打应天府，途径皖南时，兵临宁国城下。朱亮祖作为宁国守将，骁勇善战，连续多次击败朱元璋。三个月后，朱元璋采纳谋士建议，诱使朱亮祖出城，将他活捉。
当时，朱元璋求贤若渴，对朱亮祖的勇武非常青睐。因此，在朱亮祖同意效力后，朱元璋大喜，不仅赏赐朱亮祖大量钱财，还让他继续统领旧部。
然而，朱元璋的这一举动没有换来朱亮祖的感恩戴德。朱元璋攻打应天时，朱亮祖将诚信、道义完全抛诸脑后，再次起兵叛乱，大肆侵略朱元璋的领地，杀伤六千余人，又重新占领了宁国。在朱元璋无暇顾及宁国后，他又指使部下侵扰定远、滁州，背后捅刀。
朱元璋闻讯暴怒，拿下应天后，亲命徐达领兵六万围攻宁国。徐达是他麾下非常善于打攻坚战的将领，可在宁国却遭到朱亮祖的顽强抵抗，多次进攻都不见成效。
徐达久攻不下后，就停止进攻，将宁国团团包围。兵法有云：“围师遗阙。”徐达围而不攻，却留下一个缺口供朱亮祖突围。而在缺口处，徐达安排猛将常遇春驻守。可在朱亮祖强行突围时，常遇春竟抵他不过，被他砍伤。
常遇春受伤后，朱元璋大为震怒，亲自前往宁国督战。当时，朱亮祖被围数日，城内粮草不足，守军战斗意志低下。朱亮祖纵然想做困兽之斗，可他双拳难敌四手，不久就被朱元璋活捉。
然而，此次兵败被俘后，朱亮祖竟未主动投诚，甚至高呼：“我尽力了，死而无憾。”为了招募朱亮祖，朱元璋竟亲自为他松绑、斟酒。朱元璋的胸怀令朱亮祖大为感动，当即决定效忠朱元璋，不再改换门庭。
方国珍的噩梦
1363年，淮南朱元璋与湖北陈友谅终于爆发军事冲突。朱亮祖跟随邓愈克武昌、定九江，表现得非常勇猛。然而，鉴于朱亮祖降而复叛的先例，朱元璋始终未曾让他单独领兵。
鄱阳湖大战时，朱亮祖身受箭伤，仍勇往直前，奋勇杀敌。在远处观战的朱元璋非常感动，曾说道：“朱亮祖勇武，不下于常遇春。”
此战后，朱亮祖终于走入朱元璋的信任圈，被封为广信卫指挥使，坐镇浦江，监视张士诚。当时，陈友谅兵败身亡，江南鼎足之势成为双雄对立。张士诚顿感压力巨大，就率先发难，以李伯升为将，统兵20万围攻诸暨。诸暨守将胡德济兵败不敌，向李文忠求援。李文忠的大部队驻守衢州，距离较远，无法及时援助，他只好连夜赶赴浦江，以朱亮祖为将，疾驰龙潭支援胡德济。
在龙潭，朱亮祖击溃李伯升的20万大军，解除他对诸暨的包围。随后，朱亮祖又对李伯升发起猛烈进攻，连续冲击敌军大营，彻底打败李伯升，俘虏数百名战将。此战后，张士诚再也无力与朱元璋对抗。
张士诚兵败势微后，占据浙东的方国珍以方国瑛为帅，领兵十万，援救张士诚。朱亮祖随即挥兵东进，攻克天台、余杭，围剿方国瑛。大败而归的方国瑛匆匆跑到海上，才勉强保全性命。而他的哥哥方国珍再也不顾唇亡齿寒的风险，坐看张士诚灭亡。
朱亮祖作为降将，先后参与平定陈友谅、张士诚、方国珍的作战，功勋卓著。因此，朱元璋建国后，赐封他为永嘉侯，位列功臣榜第二十七位。可见，在朱元璋心中，哪怕朱亮祖曾经背叛过自己，却仍然是一位不可多得的悍将。
然而，与明初大多数将领一样，朱亮祖身上的缺点也非常多。汤和征蜀时，朱亮祖作为援军相助，可在他抵达成都后，明夏政权已被消灭。感到失望的朱亮祖竟拿部下撒气，活生生打死了一名军士，引发朱元璋的不满。朱元璋感念他的功劳，只是令他在家反省，并未严肃处置。
惨死鞭下
1379年，朱亮祖被派往广东。与沐英坐镇的云南一样，广东民风彪悍，盗贼众多，且常常受到倭寇侵扰。然而，沐英在云南，平叛乱、修水利、教导民风。可朱亮祖却建造豪宅，掠夺民财，肆意打杀百姓。当地土豪劣绅也纷纷依附于他，利用朱亮祖的权势、地位，疯狂敛财，做尽恶事。
当地知县道同不满士绅为非作歹，将他们抓捕到衙，朱亮祖却出面营救。在争论时，道同大声质问：“公乃朝廷勋略，位高权重，怎么能为这些无耻小人说话呢？”
然而，朱亮祖不为所动，见道同不愿放人，他就私下命人砸开牢笼，放出士绅，甚至为给士绅出气，当众责打道同。朱亮祖在番禺的行为，无异于“土皇帝”。
最终，道同忍无可忍，上疏朱元璋，请求他将朱亮祖调回。然而，奏疏刚离开番禺，朱亮祖就收到了消息，他命人快马加鞭，将诬陷道同的折子率先递往京城。朱元璋不察之下，竟以为道同为非作歹，当即下令朱亮祖斩杀道同。
数日后，道同的奏折抵达应天，朱元璋这才恍然大悟。可是，在他派遣释放道同的人马抵达番禺前，道同竟被朱亮祖活生生打死。道同死后，番禺各处民怨沸腾，朱元璋不敢耽误，立刻将朱亮祖父子召回应天，严加审讯。
然而，面对众多罪状，朱亮祖竟没有丝毫愧疚之心。朱元璋平生非常厌恶那些欺压百姓的官吏，朱亮祖的行为，完全是作茧自缚。因此，盛怒之下的朱元璋，当即鞭打朱亮祖父子，在严酷的鞭刑下，朱亮祖、朱暹横死当场。对于冤屈而死的道同，也算是“以其人之道，还治其人之身”了。
朱亮祖死后，朱元璋并未夺去他的封爵，反而册封他的次子朱昱承袭永嘉侯。在出席朱亮祖的葬礼时，朱元璋竟当众怒斥：
“朱亮祖父子太狂妄了，在番禺欺行霸市，擅杀道同，辜负朕的期望，今日一死，也算是死有余辜了。”
然而，朱昱却将父兄之死归咎于朱元璋。他与父亲朱亮祖早年一样，没有感念朱元璋的恩德，反而与他越走越远。
不久后，朱昱被胡惟庸拉拢，成为他反抗朱元璋的一员。然而，“胡惟庸案”爆发后，朱昱的罪行却没有被揭发。直至1390年，朱元璋在清理“胡惟庸谋反”事件的漏网之鱼时，抓获了朱昱。朱元璋盛怒之下，将朱昱一家全部斩首，名震一时的永嘉侯朱亮祖一脉，烟消云散。
