永历三年（公元1649年）以孙可望李定国为首控制云南地区的张献忠余部就已经和永历朝廷建立了联系，接受了永历朝廷的封号，并且决定出滇抗清。自滇出兵北伐必然要经过大量南明军阀控制的贵州以及四川的部分地区。自崇祯末年以来，明朝地方军队展现出军阀化的趋势，各处地方武官拥兵自重，为祸一方，勇于虐民而怯于大战，为了争一城一池不惜与同僚大打出手，而清军一到却望风归降，因此如果想完成抗清大业，必须合理地解决这些人。
明军火器。
大西军。
永历四年（公元1650年）已经成为明朝臣子的孙可望派出官员前往川黔各军阀处，要求各军阀听从调令，共扶大明。然而，军阀的本性使然，这些人是绝对不会真正地听从孙可望的命令的。1650年，孙可望大军准备开进贵州，南明将领皮熊、王祥等人来“会盟”实际上是准备阻止大西军进入贵州四川，堵住了大西军北上抗清的通道。孙可望干脆大举进攻平越，武力收编南明军队，先在平越活捉皮熊，又进兵遵义、永宁，明总兵侯天锡归顺孙可望。
明代军人。
明末精锐骑兵。
不知死活的遵义总兵王祥带领所部六七万人抵抗大西军，在乌江河一战惨败，所部大部分兵马都投顺了孙可望，王祥兵败自杀，贵州全境统一。不过贵州军阀的“悲剧”并没有让四川军阀得到一点教训，四川巡抚李乾德在给孙可望的回信中依然恶语相向，似乎准备依靠自己的兵力和大西军决一雌雄，但是有一句话叫“没有金刚钻，就别揽那瓷器活”自己那半兵半匪的队伍究竟能有多少战斗力，看来这些人确实不清楚。
明末地方军阀武装。
不知死活，那就总要付出一点代价。孙可望派王自奇大举进攻，刘文秀也逼近建昌。李乾德部下武大定（原明朝陕西副将，在当地抗清失败，逃入四川）派遣张林秀率领精兵堵截大西军，结果在荣经县一触即溃，张林秀被斩杀。李乾德麾下的南明军阀迅速瓦解。李乾德、武大定、袁韬（此人原为摇黄十三家一部）三人惊慌失措逃出嘉定城，结果李乾德、袁韬等人被孙可望部下骑兵活捉，只有武大定带领几十个骑兵逃走。李乾德与其弟弟在被押送往贵阳路上时，由于过于害怕，投水而死。袁韬和武大定（被孙可望派人召回）免罪，发入部下听用。战败的南明军队迅速被收编。割据四川各地的军阀自此也迅速归附。
明末地方军阀武装。
孙可望大军入滇黔以武力收编明军，不仅统一地方，增强抗清实力，而且大西军在进入四川贵州之后，裁撤了一批贪官污吏，注意民生，发展生产，让四川贵州等地的残存人民看到了一丝生存的希望。
明末精锐骑兵。
当然，漏网之鱼总是有的。割据涪陵、忠州一带的于大海，李占春拒绝投顺，因为此二人的义父曾英在1647年被大西军击毙，于李二人和大西军有杀父之仇，因此准备顽抗。结果迅速被孙可望击败。于李二人被夹在明清之间，里外不是人，就是干脆准备投敌。二人带领所部士卒三万人以及大批的家属在投敌的路上又遭到湖北四川交界处的夔东十三家抗清义军的截击，再次大败，于李二人率残部突出重围，逃到湖北清朝控制区投诚。
明朝北军骑兵。
擒拿反叛的罪人。
自此，孙可望彻底统一了南明控制区，综合了南明抵抗力量，推动了抗清运动的发展，同时也被西南地区的开发做出了自己的贡献。而反观割据一方的南明军阀以及地主官僚武装，御敌无术，扰民有方，甚至明目张胆地投敌，成为清朝征服南明，屠杀无辜百姓的鹰犬，其反动本质不言自明。
