成吉思汗病逝于1227年、摧毁西夏政权之前。这一年，他66岁。关于他去世的地点，曾有三种说法：宁夏的六盘山，甘肃的清水县，宁夏的灵武。其中，成吉思汗死于六盘山的观点，证据更为充分，分析更为合理，得到了多数专家学者的认同，争论也不激烈。争议最大、争议时间最久的，还是成吉思汗的葬地问题。
相传，成吉思汗在去世之前吩咐后代，一定不能让他人知道自己的墓葬所在地，然而在2002年的时候，美国考古队却口口声声说找到成吉思汗墓，但是却放弃了挖掘行动撤出外蒙古，因为他们的探险队发现成吉思汗陵墓由一条2英里长的墙壁保护，等他们靠近墙壁时突然涌出许多毒蛇。
传说成吉思汗死前曾留下三个遗嘱：一是由窝阔台继承大汗之位。二是要利用宋金之仇，联宋灭金。三是他死后秘不发丧，确保所有人不知道他的葬身之地。第三个遗嘱，就是关于他死后下葬的密旨。从中可以看出，铁木真是不希望别人知道他的陵寝所在地的。那么，作为一代帝王，都希望自己的陵寝恢弘豪华，葬礼风光无限。但铁木真为何要大费周章，隐藏自己的陵墓。以至于700年过去了，人们都还找不到他的墓葬呢？
对于成吉思汗陵墓的探寻，虽然从未停止，但至今仍如大海捞针般渺茫。随着人们对蒙古族习俗研究的深入，一种全新的观点认为成吉思汗可能采取了天葬，从而没有留下任何痕迹。这一说法的依据是出土的一本小书，是蒙古将领突拔都记载的成吉思汗病逝后的情况，书中有天葬的记载。
