贞观年间，长孙皇后肚子疼得呻吟不止，太医好一顿诊治毫无起色，赶紧请来神医孙思邈。谁料，皇后服了神医的药后，呻吟竟变成了惨叫，可把众人吓傻了……
孙思邈生于一个普通人家，从小饱读诗书，身上更承载着父亲的当官梦。可他身体瘦弱，饱尝疾病折磨，医药费像一座大山压在一家人身上，他心底生出一个念头：日后一定要学医，免费救治穷苦病人。
12岁那年，他染上瘟疫，高烧不退，卧床不起，母亲日夜守在床边，眼睛都快哭瞎了。
一位鹤发童颜的郎中在村里分发草药，喝了药的孙思邈渐渐清醒过来。后来他得知，这次瘟疫，村里很多人都是喝了郎中的药才幸免于难，自那开始，他行医救人的决心更加坚定了。
孙思邈边看医书学理论，边采药，同时，虚心向其他郎中学习。每次村里有人生病，他都主动前去了解病情，对症下药，不确定病因时，就跑去十几里外请有名的郎中来诊断，自己跟着学，对于没有钱的百姓，他更是分文不取，看病送药直到病人康复。
一天，一个妇人哭哭啼啼跑来，说儿媳生下一个断气的孩子，求他救治。孙思邈一看，婴儿全身发紫，嘴唇上全是新鲜的血渍，他赶紧找来几根葱白拍打婴儿后背，不一会儿，孩子哇哇大哭起来。
原来，孩子只是嘴内有淤血导致窒息，并非真的死亡。孩子死里逃生，一家人高兴不已，纷纷下跪致谢，都称他是神医。
孙思邈还很擅长通过调理饮食来治病。杨坚和陈叔宝打仗时，孙思邈在隋军担任军医。他发现很多士兵因为营养不良，患上夜盲症，夜里看不清东西，严重影响行军作战。
孙思邈便把鸡肝猪肝碾磨成粉，拌到饭里，缓解了士兵们的夜盲症。
由隋朝到唐朝，孙思邈一直名声远扬。有一年，唐太宗的心头肉长孙皇后不知什么原因，突然腹痛不已，“哎呦哎呦”叫个不停，太医们用尽法子却没啥效果，唐太宗握着皇后的手干着急。
此时，有人上奏：“民间神医孙思邈，有妙手回春的本领，或许能治好娘娘的病……”唐太宗立即下令，传孙思邈入宫。
满头白发的孙思邈来到宫中，因男女授受不亲，唐太宗便提出让他白纱罩面，悬丝把脉。没想到，孙思邈直接拒绝，郑重地指出，只有亲自把脉，才可以看病。
为了爱妃的性命，唐太宗只能同意。把脉过程中，孙思邈发现娘娘之所以病情加重，是因为太医们没有对症下药，便提出观气色，确定病因后再开方子。
“岂有此理！”唐太宗龙颜大怒，心想这老头儿又是把脉又是看爱妃的颜貌，搞什么名堂？
孙思邈说：“看过娘娘面色，才好下药，稍有不慎，娘娘性命堪忧啊！”唐太宗同意了，心想：看吧！若是治不好，你这老命甭想要了。
孙思邈仔细察看娘娘面色，提出娘娘肝气郁结，必须服用小儿柴胡，不想，话语刚落，众太医立即提出异议，有个太医辩解道：“书中并未提及，莫非你觉得医书有误？”
孙思邈镇定自若地说：“我学识尚浅，怎敢质疑医书，不过草本奥秘，须综合考量，若书中样样都记载，娘娘早应痊愈，为何迟迟不见效？”
太医尴尬了，他们一齐望向唐太宗。太宗面色凝重，但救妻心切，只能相信孙思邈。
服下药的皇后，浑身颤抖，冷汗直冒，呻吟声竟变成惨叫，在场的人全吓坏了，只有孙思邈一直冷静地观察娘娘的面色。一会儿功夫，娘娘的脸色渐渐有了红润，不喊不闹，呼吸均匀，竟安然入睡。
一觉醒来，娘娘的腹痛基本消失，竟嚷着要吃东西。唐太宗高兴地大手一挥：“重赏！”孙思邈谢绝皇恩，继续云游四方，救治更多身处疾病中的百姓。
孙思邈淡泊名利，一生都在钻研医学，不但救治无数病人，还为世人留下了巨著《千金要方》。他为中医贡献了毕生精力，神医的称号，实至名归!
