实际上蓝玉的跋扈不是一两天了，而是一贯如此，聚敛无度嚣张跋扈，纵兵毁关殴打士卒，强行奸淫大元皇后，导致蒙古皇后羞愤自杀，这些事换换做其他任何一个武将，朱元璋都会立即户灭九族。朱元璋之所以对蓝玉一再容忍，并且加封凉国公，实际上就是给太子朱标留下的武将班底，这一点蓝玉也是心知肚明，在这个大背景下，蓝玉就没有认为自己有生命危险。所以他才如此肆无忌惮。只是蓝玉做梦都想不到朱标会死他前面，朱标死后，蓝玉也知道，他猖狂不猖狂已经不重要了，对于朱元璋来说，他已经没有时间重新去组建班底了，杀蓝玉是唯一的选择。
蓝玉的姐夫是常遇春，常遇春的女儿又嫁给了太子朱标，本来在朱元璋的盘算中，蓝玉虽然嚣张跋扈，做事出格，但胜在忠心耿耿，关键是对太子朱标忠心不二，言听计从，等他死后可以让蓝玉给朱标当军中第一人，给朱标保驾护航，震慑地方诸王因此说，只要蓝玉在，朱棣再有一万个胆子也不敢造反。朱标死于1392年，蓝玉案发生在1393年、你很难用巧合二字来解释。朱标的突然过世，打乱了朱元璋的部署。也让蓝玉的最大的保护神没有了。再加上皇太孙朱允炆性格温和，与蓝玉也没什么关系，根本是不可能压得住性格嚣张跋扈的蓝玉，所以，蓝玉就被处死也就很正常了。
朱元璋的16个女儿，有八个嫁给了开国武将的后代，徐达，常遇春和邓愈等一系列将领家中的适龄女眷，也都纷纷嫁给了朱元璋的儿子们。这样一来，朱家和功臣之家形成了稳固的一对一姻亲关系，而朱元璋是这个姻亲关系的掌控者。而朱元璋杀蓝玉也是为了告诫各位藩王，不要指望勋旧萌生异想。朱元璋以蓝玉案为契机，蜀王、楚王、周王、晋王等藩王的岳父蓝玉、傅友德、冯胜、王弼等勋旧被朱元璋一网打尽，其中燕王朱棣的岳父徐达早就病死，否则肯定无法幸免。
胡惟庸大案和蓝玉大案是朱元璋在位期间两大案件之一，胡惟庸大案主要针对文官，没有针对勋贵和武将，换句话说，此前朱元璋杀的都是贪官和文官，在1388年时朱元璋一共也就杀了四个侯爵(都是因贪污被杀，一点都不冤)。胡惟庸、郭桓等人与开国勋贵无关。但谁都没有想到，朱元璋晚年突然转性，可以说，蓝玉案是朱元璋晚年期间最为惨烈的一次政治大案，其中蓝玉被朱元璋剥皮之后，传示全国，以儆效尤，而且株连之广远超胡惟庸案，所杀的基本上也都是勋贵集团。蓝玉案实际上就是朱元璋在朱标意外去世后的应急手段。
立国不久，主少国疑，老皇帝剪除强臣为新君铺路，这是封建王朝维护统治的常见举措。朱标一死，对于朱元璋来说，蓝玉就已经是一枚弃子了。锦衣卫指挥蒋瓛告发蓝玉谋反，不管这件事是真是假，朱元璋就借机杀了蓝玉三族，而朱元璋杀得太绝了。受此案被株连杀戮者超过1.5万人，整座京城因此血流成河。我们可以想象一下，如果不死，朱标顺利登基，以蓝玉的个性嚣张跋扈与目无法纪的行为，朱标也很难容他。
蓝玉的人皮被蜀王请求留在成都，朱元璋同意了他的要求，他是蓝玉的女婿。蓝玉人皮在成都保存251年后，明末时，张献忠攻占蜀王府，大肆搜刮金银财宝，后来搜出了一副供像，栩栩如生，询问内监才得知是蓝玉的人皮。张自忠一把火烧光了蜀王府，蓝玉的人皮也一同化为灰烬。
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