从“一代天骄”成吉思汗开始，蒙古人在草原上崛起，兵锋所向、无人能敌，建立起庞大的帝国。
蒙古大汗经历成吉思汗、窝阔台汗、贵由汗、蒙哥汗后，忽必烈和他的弟弟阿里不哥争夺汗位，引发蒙古帝国的内战。
历史最终让忽必烈成为蒙古大汗，但是忽必烈及后继者同反对他的各系汗王的内战，却是一场毫无益处的战争，白白徒耗掉帝国的实力。
忽必烈宣布继承继承汗位不久，阿里不哥在和林得到一批宗王支持，也称汗并起兵讨伐忽必烈。
忽必烈派出大军迎战，打败阿里不哥的进攻，随后断绝中原对阿里不哥的物资供应，再数次派兵征伐。1264年，阿里不哥的内部发生分裂，被迫向忽必烈投降。
阿里不哥失败后，一直支持阿里不哥的海都逃到叶密立河（今额敏河）沿岸企图反抗。
海都是窝阔台汗的嫡孙，他自以为应当继承汗位，长期对托雷系（蒙哥、忽必烈）承继大统非常不满。
海都是一个聪明的宗王，他通过同术赤系宗王修好，在其帮助下夺取了很多地方。随着军队和地盘的增加，海都成为元朝西北的大患。他同元朝的斗争延续时间较长，忽必烈生前未能收服海都。
1294年，忽必烈逝世，其孙铁木耳继位，是为元成宗。元成宗在与海都的作战中，双方各有胜负，一时之间元朝还不能平定西北。
最终的对决发生在1301年，当时海都率军进攻驻扎在阿尔泰山的元军，双方的会战于合剌合塔之地。
元军统帅海山亲自出阵，大破海都军，海都受到致命伤，于次年死去。
海都死后，元朝的西北之患解除，迎来新时期。当时，西北蒙古诸王已经对整个帝国内战感到厌恶，生产被破坏、经济变萧条、统治变薄弱，结束内战已经成为一种强烈需求。
根据汉文史料记载，1305年的时候，都哇、察八儿、明理帖木儿等宗王相聚感叹
“昔太祖艰难以成帝业，奄有天下。我子孙乃弗克靖，以安享其成，连年动兵，以相残杀。是自伤祖宗之业也。”
西北诸王现在思想都统一了，感叹成吉思汗创业艰难，不能再做败坏家业的事情了。既然你们都乖了，重新回归元朝，作为老大的元朝自然也乐意接受。
13世纪中叶以来，差不多半个世纪的蒙古内战，终于平息了。
各系宗王又回到以元朝皇帝为首的统一国家之内，但由于蒙古帝国过于庞大，各地经济和文化传统都不相同，各汗国不可避免走向自己独立发展之路。
然而，在法理上元朝皇帝，就是蒙古大汗，这是得到各系宗王承认的。那些宗王是不敢不承认的，因为
这是
成吉思汗的扎撒规定的，元朝享受对各大汗国的宗主权。
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