朱标是朱元璋的长子，母亲是马皇后，朱棣是朱元璋的第四子。建文四年朱棣即位时对外宣称生母是马皇后，但历史上一些史学家认为朱棣的母亲是朱元璋的妃子，之所以说自己是马皇后的儿子，是为了让自己这个皇帝显得名正言顺。这也是朱元璋更偏向于朱标的原因之一。
除此之外，朱元璋也考虑到其他诸多的问题，但总共归结起来就两点。
一，嫡长子继承制。在朱元璋的思维里，皇位向来是传嫡不传贤，所以哪怕朱棣在军事上有着卓越的才能，哪怕他上战场厮杀的气势像极了当初的自己，朱元璋也不会为了朱棣而打破这一规矩。
换句话说，这其实也是为了朱家江山的稳固。历朝历代，为皇位父子相残，六亲不认的例子并不少，而嫡长子继承制虽然有很多弊端，但不可否认的是这种一出生就确定了未来继承人的方式，在一定程度上也规避了很多风险。
朱元璋更偏向嫡子这一脉还有一个重要的原因就是马皇后。
所以，平定天下后，哪怕后宫佳丽三千，马皇后依然有着不可动摇的地位。而作为马皇后的孩子自然也深得朱元璋宠爱，原配的儿子自然和其他嫔妃感情更深厚些。
