公元1398年底，即朱允炆继位几个月后，朱允炆觉得自己君权太弱，想加强君权，随即用各种手段，或罗织罪名，或栽赃陷害，对大小藩王就像削藩。
建文帝朱允炆削藩，燕王朱棣得知几个亲王被撤藩死的死贬的贬，知道自己无法躲过这一劫，其他亲王命运，就是将来自己的命运。随机决定起兵造反。
朱棣一边装疯麻痹朝廷，一遍密谋起兵。但由于自己王府有人叛变，密奏建文帝朱允炆“燕王装病”。建文帝得知消息惊愕失色，决定先下手为强，立即传令燕京守军，命令张昺、谢贵领兵包围朱棣的燕王府。谁知朱棣早有防范，比朱允炆下手还早，早已在府中圈养800名死士，就在朱允炆手下包围燕王府当夜，800名死士杀出燕王府，控制北平九门，死死将整个北平城控制。
洪武三十一年（1398年）朱元璋临终时，齐泰被授予托孤重臣，辅佐皇太孙朱允炆。在建文年间六月（1399年），齐泰帮助朱允炆削藩，曾早已将燕使邓庸下狱审问，刑讯下燕使邓庸招供，燕王朱棣早有谋反之心，已经在秘密准备。
齐泰当即密奏建文帝，建文帝降旨密敕张信发兵拘捕朱棣。但是他们忽略了一个细节，张信原来为朱棣旧部，张信不但没有拘捕朱棣，反而临阵倒戈，率领拘捕之兵悉数投降朱棣，朱棣得知朱允炆已经对自己下杀手，随机准备起兵造反。战事刚开始，因为北方大多州县掌握兵权的将士都曾是朱棣旧部，所以朱棣起兵造反，应者云集，很快就控制燕京。
另外朱棣兵力增多的原因，除了旧部归降，还有就是战事爆发后，朱棣亲自率精兵强将，奇袭蒙古大宁，俘虏宁王和妻妾皇子，以此为人质，收编宁王全部骑兵，蒙古骑兵骁勇善战，战斗力极强，朱棣兵力骤增。
朱允炆在朱棣出兵大宁时候，派李景隆乘虚攻打燕京，但是朱棣早做准备，令自己长子朱高炽用水冰冻城墙，朱允炆派的部队连日攻城不能破，这时候，朱棣从大宁回师燕京。在郑灞大破李景隆军。朱允炆闻风丧胆，离开下旨免去齐泰职位，用来缓解南京和朱棣的矛盾。
朱元璋当皇帝的时候，为了防止权臣篡逆，在《皇明祖训》中说：“朝无正臣，内有奸逆，必举兵诛讨，以清君侧。”意思就是说，如果有一天朝中奸臣当道，其他人可以起兵进京，为了维护皇权清除皇帝身边奸佞。
朱棣篡位成功绝非偶然，除了自己实力外，还有就是每次都能抓住转折点，快人一步，先下手为强，处处占取主动，所以才能在充满变局中夺得皇位。
