清代文字训诂学家段玉裁，更是将明朝初年的靖难之役、景泰年间的夺门之变、以及嘉靖初年的大礼议，并称为“改变明朝历史的三大事件”。
这场叛乱爆发的主要原因，在于建文帝朱允炆为了巩固自己的权力，而采取的削藩政策，最终导致镇守北平的四皇叔燕王朱棣发动叛乱。
早在明太祖朱元璋在位的时候， 为了防止一些位高权重的大臣祸乱朝政，他专门在《皇明祖训》 中这样写到：
“朝无正臣，内有奸逆，必举兵诛讨，以清君侧。”
而且，明太祖还规定，在获得圣旨的情况下，各地的藩王拥有举兵讨伐朝廷奸臣的权利，但必须要在讨伐结束后五天内离开京城，返回各自的封地。
建文元年（公元1399年），燕王朱棣对建文帝的削藩政策十分不满，于是起兵发动军事叛乱。为了使叛乱更加合理化，他将朝廷中的齐泰、黄子澄列为奸臣，并打着“清君侧，靖国难”的口号，公开与朝廷对抗。
关于这场所谓的“讨伐”战争，朱棣既没有得到建文帝的圣旨，而且在建文四年攻下国都应天（今江苏南京）后，又不撤兵，还取代了皇帝的位置。
很明显，朱棣喊出的“清君侧，靖国难”口号，只是一个借口而已，真实目的是企图推翻建文帝的政权。
1、皇位本来就应该属于自己
自从太子朱标于公元1392年去世之后，老二朱樉于公元1395年去世，老三朱棡于公元1398年去世。也就是说，在公元1398年6月明太祖去世之前，他的前三个儿子都相继离世，那么太子之位就应该轮到老四朱棣了。
然而，明太祖却选择了太子朱标的次子朱允炆，来当下一任的皇位接班人。
明太祖之所以没有选择老四朱棣当太子，其根本原因在于，他根本就不是马皇后所生，也就是非嫡子。
按照“嫡长子继承制”和“兄终弟及”的说法，假如英年早逝的太子朱标没有儿子，可以由太子的弟弟接任。但是，有一个前提条件，那就是这个朱标的弟弟必须是嫡子，也就是由马皇后所生的儿子。
正是由于这个缘故，在任命太子的人选上，朱棣就已经被排除在外了。
“孝慈高皇后（马皇后）生了五个儿子，老大朱标，老二朱樉，老三朱棡，老四朱棣，老五朱橚。”
经过这么一修改，朱棣的生母就成为了马皇后，他自己也就成为了嫡子，继承皇位也就顺理成章了。
关于朱棣的生母究竟是明太祖的哪位妃子，也是流传了多种说法。
其中，流传最广泛的一种说法，就是在明代学者沈若霖所著的《南京太常寺志》一书中，有这样一句记载：
“成祖则碽（gong）妃生。”
其实，朱棣的生母究竟是明太祖的哪一个妃子，都已经不重要了。只需要证明他不是马皇后所生的，就足以说明问题了。
而朱棣夺取皇位后，他所做的第一件事情，就是要将自己的生母改为马皇后。
朱棣之所以要更改史料，其实原因很简单，就是要将对后人说明自己继位的合法性。因为在当时，只有皇后所生的嫡子才有资格继承皇位，妃子所生的庶子只能靠边站。
然而，仅仅是把自己更改为了嫡子，这还远远不够，同样也不能否认朱允炆继承皇位的合法性。毕竟在封建社会的“父死子继”和“兄终弟及”背景之下，“父死子继”制度明显占据了优先性。
也就是说，只要太子朱标有亲生儿子，即使朱标死去了，那么另外重新选拔太子人选，依旧没有朱标的弟弟们什么事儿。
因此，朱棣又吩咐编撰史书的文官，将太子朱标、秦王朱樉、晋王朱棡等兄弟的生母再次修改。这样一来，原本身为嫡长子的朱标却变成了庶子，而他的儿子朱允炆自然也就没有资格被立为皇太孙，当皇帝更是不合法了。
由于正史和民间流传的史料记载不一，直到如今，仍然有一部分人坚持认为，朱标并不是马皇后的亲生儿子。
实事求是地说，朱棣确实是明太祖的诸位皇子当中最优秀的一位。他不仅身材壮硕，武艺高强，而且还喜好文学，精通儒家经典，深得明成祖的器重。
明太祖将朱棣封为燕王，镇守北平。北平可是元朝的大都所在地，就是让他负责防御蒙古铁骑的入侵，保卫大明帝国的领土安全，可见明太祖对他寄予了厚望。
在父亲明太祖的安排之下，朱棣迎娶了明朝开国大将徐达的长女为妻。身经百战的徐达作为朱棣的岳父，精心指导朱棣排兵布阵，也让他显示出了军事才能。
自从洪武三年（公元1370年）开始，朱棣在北平当燕王的将近三十年的时间里，经常率领明军北上，讨伐散落在北方的元朝残余势力，而且屡屡获胜，他的辉煌战绩得到了明太祖的充分肯定。
当太子朱标去世之后，明太祖甚至产生了要把皇位传给朱棣的想法。
可是，由于明朝实行的是“嫡长子继承制”，明太祖或许是不愿意打破这种制度，才将皇位传给了孙子朱允炆。
这一点，令朱棣非常失望和不满。
洪武三十一年（公元1398年），明太祖驾崩，年仅21岁的皇太孙朱允炆接下了大明帝国的最高权杖，登基皇位，史称建文帝。
面对着一个个手握重兵的诸位皇叔，在兵部左侍郎齐泰、翰林学士黄子澄两位辅国大臣的建议下，建文帝开始实行削藩政策，以此来巩固自己的皇权。
在齐泰和黄子澄的眼里看来，分布在各地的藩王手握兵权，他们既是镇守边关的中流砥柱，同时也是建文帝皇位的最大威胁，必须要削弱他们的势力。
听完两位大臣的话，建文帝也明白了其中的利害关系。
建文帝内心深知，自己坐上皇帝的宝座，已经让各位叔叔们很不满意，他们难免会有一天利用手中的兵权对付自己。
作为众多藩王之首的燕王朱棣，建文帝决定先从他入手，下令调走了原本属于他管辖的军队。
为了防范朱棣起兵造反，建文帝任命工部侍郎张昺（bing）担任北平布政使，任命谢贵和张信担任北平都指挥使，同时命令大将宋忠在北平一带屯兵。
而且，建文帝还将朱棣的三个儿子请来国都南京，其实就是将他们当成人质，迫使朱棣不敢轻举妄动。
然而，朱棣也并非等闲之辈。
为了骗取朝廷的信任，证明自己没有谋反的野心，朱棣就开始装起病来，甚至还装疯卖傻。建文帝竟然真的相信了，于是就将朱棣的三个儿子送回了北平，让他们好好照顾朱棣。
但是这个举动，简直就是放虎归山。
其实，在建文帝刚一开始颁布削藩政策的时候，朱棣就已经感到了自己的地位岌岌可危，并提前做好了应对准备。
例如，朱棣在投降的蒙古士兵当中，秘密招募了一批忠于自己的士兵。不仅如此，他还买通了宫里的太监作为内应，随时监视着皇帝的一举一动。
看着三个儿子都回来了，朱棣再也没有了后顾之忧，也没有必要再装病了。
就在这个时候，燕王府里面的一个名叫葛诚的人，偷偷向朝廷告密说：“燕王是装疯的”。
建文帝从中似乎看出了朱棣的野心，立即给张信下达了一道指令，前去燕王府抓捕朱棣。
提前得到消息的朱棣顿时慌了，他连忙跑去北平的庆寿寺里，寻找住持道衍和尚商议。
这位道衍和尚就是明代著名的“黑衣宰相”姚广孝，也是靖难之役的主要策划者之一。
听完姚广孝的一番话，朱棣也不再犹豫了，决定举兵造反。他马上返回燕王府，命令张玉和朱能率领八百勇士潜伏起来。
建文元年七月初四，张昺和谢贵带着军队将燕王府团团包围，朱棣则上演了一招苦肉计。他假装把燕王府里的官员全部捆绑起来，让张昺和谢贵进入府内查验。
然而，当张昺和谢贵刚一走进燕王府的大门，潜伏在府内的八百勇士突然杀了出来，将他们两人擒获并处死。
当天晚上，朱棣就控制了整个北平城，并打出“清君侧，靖国难”的旗号，率兵南下。
与此同时，朱棣让儿子朱高炽坚守北平城，由姚广孝辅佐左右。
直到这个时候，明朝历史上的一场为争夺最高政权的内战爆发了，史称靖难之役。
朱棣攻入南京，建文帝下落不明
自从建文元年（公元1399年），燕王朱棣刚刚举兵谋反的时候，他的势力范围仅仅局限于北平城一带，而且手里只有八百勇士。
这种谋反势力，朝廷无论从哪个方面来对比，都占据着压倒性的优势。
可是，仅仅过了三年多的时间，朱棣的谋反大军不断发展壮大，不仅击溃了明朝军队，还毫不费力地攻入了南京城。
第一个原因：朝廷无大将可派
明太祖晚年的时候，滥杀了不少的无辜功臣，导致靖难之役爆发时，建文帝没有什么大将可以用。
在这种情况下，建文帝只好派出耿炳文率领十三万大军出征。
耿炳文将大军兵分多路，分别驻扎在河间、鄚州和雄县，这三个地方形成了一个犄角之势。
建文元年八月十五日的晚上，趁着明军都在忙着过中秋节，朱棣带着军队突然向雄县发起进攻，一举顺利拿下雄县。
眼看雄县失守，鄚州的明朝援军赶来增援，却在路上中了朱棣设下的埋伏，死伤惨重。
见此情景，耿炳文只好带着的残余的明军躲在真定府，不敢应战。
由此可见，在带兵打仗方面，耿炳文根本就不是朱棣的对手。
听说前线打了败仗，身在国都南京的建文帝立即采取措施。首先派出李景隆接替耿炳文，然后又命令辽东守将吴高率军攻打永平。
李景隆收拾完耿炳文留下的一堆烂摊子，就调集各路兵马，对外号称五十万大军，与辽东的吴高形成了前后夹击之势。
为了避免两线作战，朱棣想出了一个计策。
若是调兵去解永平之围，李景隆势必会在背后夹击，朱棣故意高调地对儿子朱高炽说：“你一定要坚守北平，万万不许出战，由我率军支援永平。”
当这个消息传到了李景隆的耳朵里，他果然上当了，没有跟吴高夹击朱棣的叛军，反而率军攻打北平去了。
朱棣用北平城成功吸引住了明军的主力部队，自己可以安心对付吴高。
孤军奋战的吴高明知不是朱棣的对手，于是撤回辽东。
就这样，朱棣不仅解了永平之围，更为日后的南下奠定了基础。
第三个原因：朱棣阴险狡诈
永平之围化解之后，朱棣率领叛军北上，来到了大宁（如今的内蒙古宁城），这里是他的弟弟宁王朱权的封地。
刚一见到朱权，朱棣就开始哭诉说自己是冤枉的。还请求朱权向建文帝进言，免除自己的死罪。
朱权信以为真，便安排朱棣在大宁住了下来。
没想到，朱棣的手下偷偷花重金收买朱权身边的将领。
眼看手中的大将都投靠了朱棣，朱权成了一个光杆司令。万般无奈之下，他也只好带领妻儿老小都去了北平，被迫跟随朱棣举兵谋反。
除此之外，朱权手下的军队全部被编入朱棣麾下，队伍逐渐发展壮大，其中还包括当时最精锐的一支骑兵部队。
看到李景隆也吃了败仗，建文帝又派出盛庸指挥作战。
当盛庸率领明军在东昌与朱棣展开决战的时候，已经将朱棣团团围住。眼看就要活捉朱棣之时，张玉和朱能各自率领一队叛军前来营救，最终得以杀出重围。
在这场战斗中，朱椒之所以能够逃出重围，除了他的能征善战之外，还有一个十分关键的因素。
在《明史·纪事本末》一书中，有这样的一句记载：
“毋使朕有杀叔父名。”
也就是说，建文帝曾经下旨说，千万不能杀了叔叔朱棣。
有了这样一道护身符，盛庸也不敢将朱棣往死里打，同时也就给了朱棣杀出重围的机会。
在“黑衣宰相”姚广孝的提议之下，朱棣决定不在山东跟盛庸率领的明军纠缠，而是一路南下，并在沿途攻城略地。
在没有跟徐州和宿州守将发生冲突的情况下，趁机切断了徐州和宿州等地的粮道。士兵若是没有了粮草，就等于是不战而溃。
明军的一位名叫何福的将领看到粮草运不进来，便带领人马前去接应粮草，却中了朱棣设下的埋伏，明军几乎全军覆没。
这一战就是历史上著名的灵璧之战。
经过这一战之后，长江以北的区域内，明朝的军队基本上再也没有抵抗的力量了。
朱棣命令大军将皇城包围，但不准进攻皇城，并将大军撤到龙江驿。
此时朱棣的意图很明显，他是在等待建文帝出来投降，主动让出皇位。
但是，朱棣万万没有想到的是，皇宫却突然起火了。
根据《明太宗实录》一书中的记载，朱棣大军兵临南京的金川城门下的时候，建文帝准备出门迎接朱棣。可是，身边的大臣都跑光了，仅剩下几个随从。建文帝嘀嘀自语说：“还有什么颜面再见皇叔，不如一把火把皇宫烧了。”
需要说明的是，当时的那具尸体究竟是不是建文帝，至今都备受质疑。
不管怎么样，朱棣还是以天子的礼仪，按照明朝最高规格的葬礼，将这具烧的面目全非的尸体下葬。
当然，朱棣或许也是心知肚明，建文帝根本就没有死。
有一次，已经当上皇帝的朱棣对身边的大臣说：“我到处寻找我父皇的墨宝，但始终都找不到。”
朱棣口中的“墨宝”，指的就是玉玺。
若是建文帝带着玉玺一块葬身火海，那么在废墟之下一定能找到玉玺，但事实并没有找到。
然而，后来的历史证明，建文帝再也没有能够东山再起，他的下落甚至还成为了一个千古之谜。
据传，建文帝的行踪也是朱棣心目中的一个梦魇，他多次派人打探建文帝的下落。一路派出胡濙秘密前往江浙一带暗访，另一路是让郑和下西洋打探消息。
靖难之役涉及的范围十分广阔，包含整个华北地区和华东地区，长达四年的反复拉锯战，使得淮河以北的社会经济遭到了很大的破坏 。
参考资料：
明代·朱元璋《皇明祖训》
清代·张廷玉、万斯同《明史》
明代·沈若霖《南京太常寺志》
明初·杨士奇《明太宗实录》
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