自古皇家多薄情，为了帝王之位，父子相争，兄弟相残，叔侄反目，历来比比皆是。
成祖朱棣，向来是杀伐决断，并无妇人之仁。靖难之役，朱棣夺了朱允炆的帝位，虽然百般掩饰，却还是脱不了篡位的干系。朱棣心中自然明了，如果留下朱标一脉，随时都可能有人扶持，举起反抗他的大旗。既然如此，朱棣自然是要斩草除根了。
朱标共有一原配，一继室，两位太子妃，以及五个儿子。
朱标原配为开平王常遇春之女，在朱标被立为太子后，朱元璋亲自册封常氏为皇太子妃。常氏共生有两子。
常氏所生长子朱雄英，也是朱标嫡长子。年仅9岁即早夭。
常氏所生次子朱允熥，为朱标嫡三子。他一出生就被朱元璋封为郡王。建文帝继位的第二年，他又受封吴王。朱棣继位，朱允熥被贬为广泽王，居住在漳州。同年又被朱棣借故将其废为庶人，禁锢凤阳。永乐十五年，谷王朱橞串通崇阳王朱悦燇诈称“建文君”谋反，朱允熥当年暴卒。其子朱文坤，下落不明。
据《明实录》的记载推测，明朝中后期有建庶人和吴庶人两家族，被明朝廷严加看管，推测吴庶人即朱文坤后人。而建庶人么，据说是建文帝二子的后人。
朱标的继室吕氏，为大臣吕本之女，原为朱标妾室。朱标原配常氏去世后，吕氏成为了朱标的继任太子妃。吕氏共生有三子。
吕氏所生长子，即朱标次子建文帝朱允炆，靖难之役后，下落不明。建文长子朱文奎，同样不知所终。次子朱文圭，史称建庶人，一直被明朝廷严加看管。
吕氏所生次子，即朱标四子朱允熞。建文帝继位，他受封衡王。朱棣继位后，被降为怀恩王，居建昌。同年，和他的三哥朱允熥一起被废为庶人，禁锢凤阳。其具体卒年史料无载，推测最迟应该是在永乐十五年，和他三哥朱允熥一起被杀。无子。
吕氏所生三子，即朱标第五子朱允熙。建文帝继位，他受封徐王。朱棣继位，他被贬为敷惠王，跟随其母吕太后居住在太子朱标的懿文陵。其三哥朱允熥和四哥朱云熞被贬为庶人，圈禁凤阳之后，朱允熙改封瓯宁王，奉祀朱标。永乐四年，因宫邸失火被烧死。无子。
朱标另外还有三位史料有明确记载的女儿。
江都公主，朱标长女，嫁给了耿炳文之子耿璿为妻。永乐年间，耿璿被连坐致死，江都公主被降为江都郡主，后忧郁而死。
宜伦郡主，朱标次女，永乐十五年，下嫁大臣于礼，后无记载。
南平郡主，朱标四女，仅有永乐十年的去世和追册记录，无成婚记载。
朱标的长、次、四女都有了，那还应该有一名三女，但是史料无记载，很可能是夭折，或者下落不明了。
