为了让朱家天下永续流传，朱元璋费劲了心思，他采用分封制，册封自己的儿子为藩王，到北方边塞、腹地战略要地镇守，并给予藩王很大的权力，如自主统兵等，希望以血缘关系为纽带，形成诸子看守边关，拱卫京师的局面。
然而人算不如天算，太子朱标英年早逝，长孙朱允炆继位后，发现藩王尾大不掉，成了朝廷的心腹大患，于是着手削藩。按照朱允炆的策略，先从弱者下手，逐步孤立强藩，以达到加强皇权的目标。
等削到燕王朱棣时，手握十万大军的朱棣，并不想坐以待毙，于是在燕京起兵对抗朝廷，借口朝中奸臣当道，以此举兵清君侧，这是朱元璋遗训允许的。但明眼人都知道，朱棣是以下犯上，道义上不占理。
朱允炆虽然强力削藩，打算把叔父们都撸个底朝天，但毕竟是正统皇帝，所以能够号令全国，按理说有足够的实力碾压朱棣，事实上也是如此，可大好局面偏偏被朱允炆一句话给葬送了——
话说，朱允炆知道朱棣造反后，驾轻就熟地祭告了太庙，当着朱元璋的牌位，把朱棣逐出家门，打为庶人，并积极起兵讨伐围剿。他派出的第一员主将叫耿炳文，是朱元璋手下最擅长防守的将领，他曾坚守长兴十年之久，让张士诚束手无策。
在与朱棣的对战中，耿炳文虽然打了败仗，但很快就稳住了阵脚，准备长期坚守，这让力求速胜的朱棣很无奈。然而不久之后，朱允炆嫌耿炳文军败、死守，于是让李景隆接替，成为三军主帅，李景隆虽是名将之后，但并无军事头脑，只是一个富家纨绔子弟，结果可想而知，败得一塌涂地。
即便如此，朝廷虽然有损失，但远没到伤筋动骨的地步，朱允炆仍旧有很大的胜算。反观朱棣，虽然胜多败少，但经不起消耗，大将张玉也阵亡了，压力越来越大，长此以往下去，迟早会崩盘。尤其是到了靖难之役的第二阶段，因为朱允炆交代了一句“毋使朕有杀叔父名”，束缚了所有前线将士的手脚，朱棣却由此立在了不败之地。
比如白沟河一战，双方进入决战时，朱棣大军被偷袭，几乎到了崩溃的边缘，朱棣自己也亲自操刀上了前线，冒着枪林弹雨，冲击李景隆的中军，结果没有一点效果，情急之下，朱棣只好亲自率军强行攻打，混战之中，飞矢如雨，朱棣先后换了三匹马，射光了三筒箭，宝剑也砍断，却没受一点伤。
后来的战斗中，也几乎一样，朱棣经常亲自到阵前侦察，甚至到了朝廷军的跟前，抵近视察一样地查探虚实，朝廷军却从来没有趁机痛下杀手，而是眼睁睁地看着朱棣大摇大摆地来、大摇大摆地走。不仅如此，朱棣战败后，往往会亲自断后，让朝廷军无从下手。
其中的奥秘就是朱允炆的那句“毋使朕有杀叔父名”，该不该杀朱棣，从军事上来说，擒贼先擒王，杀掉朱棣，平叛就成功了一大半，但朱允炆却模棱两可的交代，让所有前线将士都不敢对朱棣动手，导致朱棣有恃无恐，结果反杀了朱允炆，可惜之至。
