一、事业单位分类改革将事业单位分为三类：行政类、公益类和生产经营类。
1、行政类事业单位：是指承担行政审批职能的事业单位，包括行政执法类，改革方向是将所有的行政审批职能划归行政机关承担。行政类事业单位，按照完全、主要、部分承担行政职能分为三类，完全承担的，将单位所有职责划归主管部门机关来承担，单位撤销；主要和部分承担行政职能的，则是将承担的行政职能划归机关，单位整合或者保留。
行政类事业单位改革完成后，今后不会再审批成立此类事业单位。由于行政部门同样在改革，在简政放权，在压缩编制，因此，不可能连人带编，按照“编随事走、人随编走”的原则，将人和编制随职能调整到行政部门，而且行政机关也不允许同时使用行政和事业编制，混岗混编。因此，职能调整后，人员会分流到其他事业单位，依然保持事业人员身份。由于队伍过于庞大，执法类事业单位依然保留事业单位属性，而且还要取消事业单位参公管理的方式，事业单位今后不再参公管理。
2、公益类事业单位：公益类事业单位，按其承担的公益职能的比重，又被分为公益一类、公益二类。公益一类是完全或者主要承担公益服务职能，公益二类是部分承担公益服务职能，同时还承担收费或者营收职能。公益一类事业单位是今后事业单位的主流方向，不管是整合还是单设，都不影响其事业单位性质。而公益二类事业单位中，除将承担的公益服务职能整合，向公益一类单位靠拢之外，还要将承担的收费、营收、中介等职能，推向社会和市场，实现公平自由竞争。
3、生产经营类事业单位：凡是自收自支，有生产产品和经营收入的事业单位，将全面脱离事业单位序列，改制为企业，自主经营，实现管办分离、政企分开。改企之后，正式职工分流到其他事业单位工作，合同制管理人员和自收自支人员，全部推向社会，自主择业。自收自支类、自定和筹类事业编制全部取消。
二、按财政供养，事业单位可以分为全额、差额事业单位和自收自支类事业单位。全额和差额事业编制也是有严格的区别的，是分开统计的。随着改革，自收自支类事业单位将全部消失，而差额事业单位除乡镇卫生院外，其他都是逐渐剥离营收职能，机构会越来越少，人员编制都会被压缩。
三、按照管理方式，将事业单位分为参公事业单位和非参公事业单位。参公，是指参照《公务员法》管理的事业单位，其人员管理、工资待遇、晋升方式等，都和公务员没有区别，只是使用事业编制而已。这部分单位，主要是指承担行政职能和行政执法职能的事业单位。事业单位改革之后，参公的事业单位也会取消参公性质，事业单位不会再有参公不参公的说法。事业单位一律按照《事业单位管理暂行条例》管理，或者正式颁布的管理办法、法律法规，不再参照《公务员法》管理。
事业单位正式的分类基本就这几类，其他还有按行业分类的，还有习惯上分类的，比较容易理解，就不一一介绍了。
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