母后皇太后和圣母皇太后两宫并立的局面最早出现在明朝，明英宗正宫钱皇后和宪宗生母周贵妃被分别尊为两宫皇太后，出现这种情况一般是先帝正宫皇后无子，庶子继位造成的。
我们先简单解释一下母后皇太后和圣母皇太后的区别
按照宗法制度嫡长子继承制是一项基本原则，嫡长子即正妻所生长子，一般情况下庶子是没有皇位继承权的，但是清朝由于是少数民族政权，并未完全遵从嫡长子继承制，所以在清朝出现过多次两宫并立的情况，最为人熟知的当属同治时期的慈安、慈禧两宫太后。
一般在庶子继承皇位之后按例应封先皇正宫皇后为“母后皇太后”，新皇的生母则为“圣母皇太后”。
中国自古讲究尊卑有序，母后皇太后由于是先皇正宫，本就是母仪天下统摄六宫，即便是两宫并立，其地位自然也高于母以子贵的新皇嫡母，所以在后宫自然是“母后皇太后”的地位更高。
还以慈安和慈禧为例说明一下两宫太后间的关系。
1861年咸丰帝驾崩时，由于皇后钮祜禄氏无子，仅留下叶赫那拉氏所生育的独子爱新觉罗·载淳继承皇位，根据《清史稿》记载，同治登基后“九月丙戌朔，上母后皇太后徽号曰慈安，圣母皇太后徽号曰慈禧。”两宫并立局面形成。
同治继位后两宫太后联合恭亲王奕䜣发动了“辛酉政变”，形成了垂帘听政的局面，时以东宫太后慈安为尊，虽然慈禧权力欲很大，但是在慈安面前慈禧不敢造次。
慈禧虽然时皇帝生母，但是由于嫡庶之别，年长慈安两岁的慈禧还得恭恭敬敬的称慈安为姐姐，凡涉及朝政大事慈禧也得请示慈安定夺。
慈禧心腹太监安得海就是慈安太后立命诛之，另外同治皇帝大婚选阿鲁特氏为皇后也是慈安太后力挺，从这两件事可以看出宗法制度中尊卑有序的威力。
所以两宫并立“母后皇太后”比”圣母皇太后“更为尊贵。
