唐代宗是安史之乱后的第二位皇帝，还是太子的时候就率领大军镇压过安史之乱，对军队极为看重，即位后对神策军进行了第一次大规模扩编，先后收编了平卢节度使、朔方节度使等部的军队，这些军队都是久经沙场的悍卒，依靠这些军队的加入，使得神策军的实力大大增强。广德元年（公元763年），吐蕃进攻长安，太监鱼朝恩护卫唐代宗依靠的正是神策军。然而不巧的是，后面的事情让神策军开始“面目全非”。
唐德宗即位后，建中四年（公元783年），朱泚率领的本来要镇压地方叛乱的边军在长安造反，唐德宗不得不出逃，当时仅有数名太监跟随。在叛乱被平定后，唐德宗对文武大臣的信任度降到极点，反而更加信任宦官，于是开始任命宦官为神策军的指挥使，从此为唐朝中后期的宦官干政提供了武力依据。正是依靠着神策军的武力支持，宦官们才能在后期掌握皇帝废立，引发了严重的政治危机。后来的神策军不仅帮助宦官，更沦为特权阶层晋升的通道，神策军军饷三倍于其他军队，而且在升迁上有优先权，于是贵族高官无不想把子弟送入其中，使得神策军实力大大下降。
