孛儿只斤·铁木真于1227年8月死于第二次攻打西夏的军营之中，一代“战神”的生命划上了句号。早在西征前，成吉思汗的第三大斡耳朵的主人皇后也遂，就继承人的问题问过成吉思汗，大汗身体如有不测，应该立谁为汗，好继承你的事业，成吉思汗没有因为也遂问这样敏感的问题而发怒，而是平静的回答了也遂的问题，表示这个问题应该解决了，随后召开忽里勒台大会，宣布第三子窝阔台为自己位置的继承人，这就引起了长子术赤，和幼子拖雷的不满，因为按照蒙古人的习俗，长大的儿子要分父亲的土地，马匹，等财物自己独自生活，留下幼子和父亲一块生活，继承父亲的一切，这就是幼子守产制度。幼子拖雷按说他应该最有可能成为继承人，而且拖雷深受父亲喜爱，每次出征铁木真都把拖雷带在身边，亲切的称他为自己的那可儿（伙伴），拖雷也勇敢善战，屡立战功，但是父亲没有选择他。拖雷不选，下一个该是长子术赤，但是术赤有别的原因不可能继承汗位，兄弟大吵一架，这就为以后的纷争埋下了祸根。
成吉思汗死亡前夕，再一次把大家聚集在一起，明确了窝阔台的继承人地位，并且教育了自己的儿子要团结，举了五子折箭的故事。四个儿子窝阔台继承汗位，其他三个儿子各自分得一片土地为自己的封地。窝阔台要想顺利登上汗位，光有成吉思汗的遗命是不行的，还要把宗室亲贵，大将，万户，聚在一起召开忽里勒台大会，得到大家的推选才可以。忽里勒台大会两年之后才召开，在这期间拖雷监国摄政，两年之后拖雷的支持者术赤死了，老二察合台支持窝阔台，拖雷就这样不得不也推选窝阔台为大汗。
窝阔台成为可汗之后，由于拖雷掌握着蒙古帝国百分之八十的军队，他被窝阔台视为眼中钉肉中刺，窝阔台再也不像以前那样宽厚，仁慈了。三年之后，在打败金国的回军的路上，他借口生病，巫师为他乞求神灵，让弟弟替他生病，把下了毒的符水让拖雷喝下，窝阔台病好了，拖雷几天之后死了。九年之后，窝阔台也死了，他的皇后乃马真摄政五年，她笼络大臣，对王室贵族大肆封赏，得到大家的拥护，忽里勒台大会推选她生的长子贵由为汗。贵由和术赤长子拔都不合，两年之后，以西巡为名准备进行西征讨伐拔都，不幸走到横相乙儿(今新疆青河东南)时，贵由也死了。
贵由死了之后，窝阔台系的势力大减，贵由皇后海迷失抱幼子失列门垂帘听政，两年之后召开忽里勒台大会，大家推选拖雷长子蒙哥为汗，从此汗位转移到拖雷一系，贵由皇后海迷失被投入河中溺死。蒙哥成为大汗之后，1259年进攻南宋，在合州(今重庆合川区)钓鱼城下被南宋军队直接射杀。蒙哥的突然死亡，继承人又成了问题，他的弟弟忽必烈赶快回到燕京登基称汗。他的另一个弟弟阿里不哥在哈拉和林成为大汗，一时间蒙古帝国有了两个大汗，怎么办？只有开战，五年之后阿里不哥被忽必烈打败，不得不投降忽必烈，忽必烈改国号为元，建都北京，随后即举兵南下，直至1279年灭南宋。
