1644年，那是非常特殊的一年，那一年同时有着三个年号：崇祯17年，永昌元年和顺治元年。44年的春天，闯王李自成的大军已经兵临北京城下，将大明王朝的最后一任皇帝崇祯困于城中，几天之后，北京城破，崇祯皇帝在故宫后山上自缢身亡，闯王入主紫禁城。从边关回京勤王的吴三桂，在路上就收到京城陷落，皇帝自杀的消息，于是引清军入关，想要联清击李，李自成在山海关一触即溃，屡战屡败很快也退出了历史舞台。而你现在便是围困北京城的一员闯军。
驻扎北京的三大营你随着围困北京城的大军一起驻扎在北京城外，大炮声在你的四周不断响起，脚下的大地似乎也跟着摇晃，不光是你，你身边的战友一个个面孔上都透着掩饰不住的慌张神色，血红的眼睛里满是恐惧，还有一抹对未来的绝望之色。你们听说此时北京城中仍有几十万的三大营在驻守，此前清军也曾多次兵临城下，坚守几个月后也都没有攻克北京城，你们知道在北京的士兵各个都已是身经百战，而你们却只是一群缺乏装备的泥腿子。你想起上次攻克宁武关的惨状，满地的鲜血，染红了整个大地，尸体铺满了前去的路，你甚至不知道你是怎么活下来的。仅那一战你们便折损了上万精锐，而这次你们的眼中都不约而同的透露着一丝绝望。李自成的议和其实不光是你们，你们上头的将领们也对这次攻城缺乏信心。闯王李自成在围困北京城后不久便开始议和。上书自己并不是反贼，希望大明皇帝册封一块封地，赏赐100万两白银，让自己能够成为大明的一个藩王，成为藩王之后还能帮大明攘外安内，镇压其他的农民起义军，抵抗满清镇守边关。当然为谁卖命其实与你关系不大，你只是想在这个乱世中能混一口饭吃，当兵吃粮，吃粮当兵。当然相对于城下之盟来说，这个议和条件显然是非常优厚的，缺乏实力的闯军上下其实都觉得攻下北京的可能太小了。所以在围困京城，仅一步便入主中原后，闯军放弃了，只是要些封赏便会离开。
三大营的奇怪战力议和还是破灭了，闯王下令开始可攻城，可是仅仅是短暂的攻击之后，守军便纷纷献城，你甚至对这轻而易举的胜利觉得不可思议，在你们进入京城后，发现守城的军队远没有几十万，可能仅仅只有几万人，北京城的空气中也笼罩一种奇怪的气息，你也没有太在意，可能是这些人在城破后的恐惧。迅速溃败的闯军你们成功的攻下了北京城，紧接着便是对降军的收编，可是很快，你身边的战友有人得了一种奇怪的病，他们开始发烧，咳嗽，呕吐，很快士兵一个接着一个的晕倒，一个接着一个的倒下，你们所有人都害怕极了，这种病并不光击溃了军，更击垮了你们的人心，你每天都在害怕，害怕下一个会不会就是自己，你虽然早已见惯了刀剑的厮杀与死亡，但这种无形的死亡显然比它们更甚。仅仅过了40天的时间你们便又仓皇撤离。在此期间，你们也曾进攻山海关，却又被吴三桂和清军打败。军中瘟疫一直没有停止，光处理瘟疫都让你们精疲力尽，面对每天死亡的战友，每个人都心情低落，面对不可战胜的敌人，你们都失去了斗志，逃跑的思想在军中疯狂传播，你们都只想远离这这地狱，你和你的战友们变成了一群乌合之众，一触即溃，只要一开战便四处溃败。你们甚至放弃了对坚固北京城的固守而是直接弃城。
闯军为何会迅速是战斗力？是迅速的腐化，还是另有原因之前对此的解释多是闯军进入北京城之后腐化堕落了，失去了战斗力。但短短40天，如何让起义十余年训练有素的闯军迅速堕落？而且闯王也曾占领过其他豪华的大都市，洛阳、西安，为何偏偏就是北京？300年前的欧洲黑死病而以上一连串疑团的关键便是——鼠疫。1644年，正是全世界鼠疫的第二次大流行期间。而这便是300年前欧洲黑死病。当李自成兵临北京城下的时候，城中其实已经爆发了鼠疫。本就人口众多的北京城，加上大批逃难涌入的难民，瘟疫不可阻止的爆发了。号称守军40几万人，但是能够有效动员起来的战斗力只剩几万人了。和谈失败之后的李自成只是想惩罚性的攻城，可谁想到守军纷纷献城，瘟疫不仅击溃了军队，更击垮了人心。在这样的关键时刻，爆发百年不遇的骇人瘟疫，在古人看来，是上天在传达一个消息，大明已经被时代所抛弃了。
感染鼠疫的闯军攻克北京城后，随着对降军地收编，频繁的接触，本来缓和的瘟疫再度爆发。闯军在短短40天就失去了战斗力，这一切的原因不是北京的花花世界，而是满城看不见的鼠疫杆菌。李自成山海关一战失利，离开北京，一路退却的同时，就把也把瘟疫传播开来了，闯军各地留守的部队先后感染。所以后来弃山西，弃西安，最后败死九宫山。在古代的卫生条件之下，一旦军营出现瘟疫，整个部队都可能不战而溃。1644年的春天，肉眼看不见的细菌改变了历史，它助中国最后一个王朝登上了历史舞台，完成了它的历史使命之后，骤然消失，等待着下一次历史的召唤，人类也在努力争取掌握自己的命运。
