首先，李世民并不是开国皇帝，在唐高祖时期，兵权就已经掌握在他自己的手里了。
在公元621年（武德四年），右将军大都督李世民带领攻下洛阳，击败王世充、窦建德联军。李世民因战功显赫而名声大振，唐高祖命他掌握东部平原文、武两方面的大权，封李世民为天策上将，并且允许他在洛阳开天策府。
天策上将府，位列武官官府之首，在十四卫府之上。李世民大权在握，可以自己安置官员。
当时天策府的文臣武将，有不少是从敌营过来的，但他们在长期的战争中，和李世民结下了深厚的战斗情谊。这些人里面，尤其是秦琼这一类的武将，虽然有挂帅领军出征，但真正的兵权还在李世民手里，被李世民掌控着。
这些武将一直都追随着李世民东征西讨，李世民能和太子李建成在争夺皇位中胜利功劳可少不了他们。在李世民称帝后奖励耕种，促进了社会经济的发展，同时在军事上，多次对外用兵，先后平定了突厥、薜延陀、回纥、高昌、焉耆、龟兹、吐谷浑等。当时的唐朝声威远播。
所以说，李世民要这些武将还有用，当然不会把他们抛弃了。咱们接着说秦琼，秦琼在李世民称帝后虽然他当时的官职是左武卫大将军，爵位是胡国公，但是由于秦琼经常生病所以没有多少亲自领兵作战的机会。
还有就是这些大臣将领手里面并没有多少比较实在的权利，对李世民根本构不成威胁。
