神树纹玉琮，出土于三星堆3号祭祀坑。中国社科院考古研究所研究员、著名考古学家王仁湘教授认为，此物身上有着3个不同寻常的地方：首先，仔细观察这个玉琮你会发现，神树的下面绘有两层底座。按照现代艺术品的设计逻辑，这双层底座，必然是可以转动的。那么问题来了，三星堆的先民们，为啥要将自己日日祭拜的，能沟通天人的神物，设计成可以转动的“艺术品”呢？他们不觉得这样是降低了神树的“神性”么？
其次，在神树纹玉琮的底部，工匠特意刻上了两条平行线。很明显，这是代表了地平线。也就是说，神树原本是树立在地面上的。请注意，这种绝对现实主义的雕刻方法，在中原文明中并不多见。第三，也是最诡异的一点是，在此之前，专家在钱塘江流域和太湖流域的良渚文化遗址中发现过不少玉琮。但那玉琮上面，要么没有花纹，要么就是一些神面。将神树雕刻在玉琮上，三星堆是唯一的一个。
于是有专家怀疑，说良渚文化与三星堆之间，是否有着某种渊源？事实上，据《尚书》、《山海经》等古籍记载，夏朝时期，东方有个有穷氏部落，其首领叫大羿。注意，此人和射日的后羿是完全不同的两个人。当时的夏王是太康，此人疏于朝政，只喜欢打猎、游玩。有一次，趁着他出门打猎的机会，大羿突然发动袭击，夺取了夏都，赶走了太康。其后裔少康，靠着母族的帮助，打败了大羿，史称少康中兴。
然后，他似乎又攻击了有穷氏部落，迫使大羿带着族人离开家园。他们一路沿长江而行，很可能进入了良渚先民的活动范围。且与当地的古人发生了争斗。证据就是，据《山海经》记载，大羿曾在洞庭湖附近射杀过一条大蛇——修蛇（很可能是个以蛇为图腾的部落）。而洞庭湖离钱塘江并不远。另外，在前几次的三星堆考古发掘中，专家找到了一根金杖。
上面显示，有个善于射箭的外来部落，曾重伤了广汉平原上的两个以鱼和鸟为图腾的土著部落。各位，将此事与这件神树纹玉琮结合在一起看，咱是否能做出如下推测？以大羿为代表的有穷氏部落，在逃跑过程中与良渚先民发生过冲突和融合。在这过程中，他们认可了玉琮的神性，并最终将其带入了广汉平原。
随后，有穷氏遗民、良渚先民，与三星堆古人，在广袤的广汉平原上，不断地交战、融合，最终形成了崭新的三星堆人，他们将自己原创的神树，与外来的玉琮结合在了一起，创造出了这么一件国宝。可惜由于他们没有文字流传下来，所以才使得数千年后的我们，满脸疑惑地审视着这个神树纹玉琮，引发无限遐想。
