明末时期，李自成领导的农民军新军派系经常能够打败明朝的正规军队，原因有以下几个方面。
首先是明朝政府在军队上的管理方面存在着诸多问题，许多军队指挥官为了自身利益缺乏忠诚，领导失策也屡见不鲜。此外，明军干部系统未能按照官品和能力配备军官，人心不齐、指挥混乱的问题也日益严重，这为李自成的农民军提供了打败正规军的机会。
其次是明朝军队的装备水平和训练程度都不如李自成的农民军。在装备方面，明朝的士兵使用的是木制的简陋火器和缺乏保护的盔甲，农民军则使用着轻装备和灵活的武器，使得其在战场上能够更加轻便灵活，更加利于作战。在训练方面，明军士兵的训练不如农民军严格，使得农民军的士气和战斗力有一定优势。
此外，李自成的农民军人数众多，士气高涨，在农村中可以得到良好的补给，而明朝官兵大多是贫民或土豪子弟，需要忍受艰苦的生活、饥饿和疾病，很多士兵因为生活困难而叛变，这使得明军的战斗力更为脆弱。
需要注意，明朝时期的政治、经济和文化等方面也都对明军的实际战斗力造成了重大影响，这些因素加剧了明朝在战争中的困难，同时也为农民军的发展提供了更为有力的支撑。
