1367年11月，方国珍赶赴南京会见朱元璋，请罪。当他看到朱元璋的时候，发现他的脸色阴沉，嘴角不由得勾起一抹冷笑。就算胆子大的人看到了，也会觉得有些毛骨悚然。
朱元璋见了后，下诏晋封方国祯为广西左丞相，并赐他一幢专宅。然而，在谈到唐和平平定浙东的事情时，朱元璋顿时面露凶色，责备方国珍：
“你现在投降是不是有点晚了？”
方国珍吓了一跳，跪在地上连连磕头。此后的七年里，他日夜躲在府中，任凭群臣如何催促，仍不愿赴广西就职。
1348年起，元末方国珍掀起起义浪潮，韩山童、徐寿徽相继起义。然而，在元朝末年的起义军中，韩山童被元兵所杀，徐寿辉死于陈友谅之手，陈友谅战败被杀于鄱阳湖，张士诚后绝食而死。被朱元璋围攻。直到朱元璋称帝，只有方国珍幸免于难。
那为什么方国珍不愿意去“山高天高地远”的广西呢？他在担心什么？多疑的朱元璋会放过他这个“元末好汉”吗？
反元首正义
众所周知，元朝末年，暴政如虎，地方官员乘虚而入，激化了社会矛盾。贾鲁开河后，颍州人韩山童用民歌《石人独眼挑黄河对岸造反》，召集反元义士，拉开反元大幕。他们系红领巾，被称为红领巾军。
韩山童起义三个月后，徐寿辉也在长江流域发动了大规模的反暴政起义。然而，领导南北红巾军起义的韩山童和徐寿辉并不是最早“举起杆子”的义士。
方国珍才是真正的“反元首义”。 1348年，在浙东沿海贩卖走私盐的方国祯被仇人陷害，被朝廷通缉。方国珍杀死仇人后，便和他的四个兄弟纠集了数千人，开始了一场劫掠劫掠的运动。
方国珍身材高大威武，朝廷派人前来捉拿，方国珍顷刻间杀光了所有抓捕他的人。不久之后，浙江之行参加省府的多尔支队5000名士兵围剿方国珍。然而，在方国珍和这群“土匪”面前，经过正规训练的元兵完全不堪一击。方国祯只用了半天的时间，就将元兵全部击溃，擒获多尔知班。
夺取多尔之班，震惊了整个浙江。当时，地方官员腐败盛行，军训似乎白费功夫。初战失败后，地方官员胆战心惊，不敢再派兵征召，只好安排使者出海征召方国珍。
方国珍是个彻头彻尾的机会主义者。像北宋的宋江一样，向往大鱼大肉的幸福生活，不顾百姓疾苦。造反元前，他多次掠夺当地百姓，造反元后，他对百姓再无仁慈之心。
然而，元朝的官员们习惯于撒谎。招募方国珍后，他们并没有兑现之前的承诺。对于一个极度自私的人来说，这是一种极大的屈辱。于是，方国珍再次弃官开始偷窃。他不仅恢复了抢船生意，还率军攻占了元朝重镇温州。
方国珍的第二次起义，显然比第一次更加惊心动魄，浙江官员再也隐瞒不了，只好上报朝廷。不久，波罗帖木儿率领十万大军南下浙江镇压方国珍。不过，波罗帖木儿的士兵并不熟悉水战，几个回合下来，就成了方国珍刀下的亡魂。和多尔吉班一样，波罗帖木儿也成了俘虏。
元顺帝和浙江官员对“叛”的政策如出一辙，先战后招。打不过，可以招保安。如果招不到保安，就坐视不管，假装“造反派”不存在。因此，在波罗帖木儿被俘后，元顺帝立即派大司农达去招揽方国珍。
至于对听中尘，大石铁木儿带来的奖励，可比浙江省要大的多。方国祯顺利当上了枢密院判官，手下也纷纷效仿。不过，在元朝内部，对昭安方国珍不满的人还是有一个。
刘基认为：“方国珍是先造反，投降又造反，造反又投降，这种毫无公信力的人，即使暂时屈服于朝廷，也一定会再次站到元朝的对立面。在将来。”
刘基对方国珍的为人了解得很透彻，但在朝堂内部，大家的态度都是事多不如事少，根本没人在意认真的刘基。
三降三叛
三年后，韩山童在淮河流域发动红巾军起义。韩山童和方国珍不同。他有着推翻暴政吞噬天下的野心。于是，元顺帝派蒙古大军蜂拥南下，讨伐汉山通。当时，方国珍已享三年荣华富贵，趁机收了很多人的脂油膏。眼见蒙古大军南下，方国祯担心元顺帝打败韩山通后，会趁机收拾自己。于是杀了台州道主将大禄华赤台不化，再次脱离元朝。
方国祯第三次叛元，一方面是担心蒙军进攻影响到自己，另一方面又有“带兵自尊”之嫌。他本来就是一个很会炒作的人。在元朝末年的乱世中，方国珍向来善于通过不断造反和敲诈朝廷来获取更多的资本。
不久，元顺帝授予他“徽州路知忠”称号。然而，方国珍不为所动，攻下太仓，与元军一决高下。其实这不过是方国珍的小心思罢了。韩山童起义后，北方红巾军和徐寿徽的南方红巾军严重冲击了元朝在淮河、长江流域的统治。淮南地区，元顺帝根本无力管。如果此时方国珍向元朝投降，他无疑会取代元兵，成为韩山童和徐寿辉的活靶子。
然而韩山童被杀后，刘福通扶持的韩林儿却无力反抗元军队进攻。徐守辉被倪文君控制，变成了傀儡，天万军内部纷争不断。更让方国珍担心的是，张士诚在苏州的异军突起，已经严重威胁到了他的地盘。于是，方国珍第三次选择向朝廷投诚，接过元顺帝任命的“浙省参政”一职，成为新疆的大官。
方国珍之前两次叫保安，都是躲在台州路的指挥下自娱自乐。但这一次不同，他身居要职，自然要肩负起朝廷的重任，而元顺帝也有意让方国珍与张士诚自相残杀。于是，在朝廷的授意下，方国珍这个“反元首义”向“队友”挥下屠刀。
方国珍人品虽然逊色，但军事才能确实出众。当张士诚手下的将领陆振、史文兵率领七万大军迎战时，方国珍手下的将领们都被张士诚的兵力压得喘不过气来，失去了必胜的信念。只有方国珍对此不屑一顾：
“连海石诚以步骑，兵虽强，不惧。”
战争的结果果然如方国珍预想的那样，在江河遍地的沿海地区，张士诚的步兵和骑兵虽然强悍无比，但用处不大。方国珍七战全胜，一路杀到苏州城下，逼近了张士诚的老巢。
方国珍的谋士张子善曾劝他除掉张士诚，并趁机吞并江东各地，图谋中原。但方国珍是个胸无大志的“山王”。他最大的梦想就是在朝廷的加持下封妻，成为一个无忧无虑的富豪。
所以，在张士诚虚伪地向朝廷投降之后，方国珍立即回到了自己的住处，享受着逍遥自在的生活。战后，方国祯被元顺帝封为左丞、浙江太尉。与被招安的宋江等叛军相比，方国珍的待遇可谓深远。
不过，方国珍没有得天下的野心，朱元璋却有。在楚州异军突起的朱元璋，趁着红巾军与元兵交战，徐寿徽内部不稳之际，攻占金陵，进而占领皖南、浙东、苏北。
1358年，方国珍居住的清远，几乎在夹缝中幸存下来。西边是他的死敌张士诚；南边是陈友谅的弟弟陈友鼎。而朱元璋手下的大将胡大海再次攻占梧州，与方国珍关系密切。
在此危急形势下，方国珍发挥“灵活可伸缩”的天性，派人前往金陵，向朱元璋献上黄金五百两、白银数千两，主动提出投降。朱元璋虽然势力强大，却不断被元兵打压。因此，在方国珍要求投降后，他立即命令胡大海不得攻击方国珍，并将官职和印章送往清远。
然而，方国珍的自首请求是假的。他对朱元璋给他的官职不感兴趣，连使节都没见过。与此同时，元顺帝册封他为屈国公的圣旨也到了方府。方国珍的脑袋在老鼠的两端，来回摆动，犹豫不决。
一个好的死亡
五年后，朱元璋在鄱阳湖大败陈友谅。除了明玉珍占领的四川和蜀地外，徐寿辉生前的所有基业都被朱元璋吞并了。而手下的大将胡深也趁势攻打温州，这让方国珍胆战心惊。
当时，方国珍又给了朱元璋“三万两银子”，才勉强劝说朱元璋绕过温州，围剿张士诚。方国珍承诺，只要朱元璋攻下平江，他就全城投降。
然而，在徐达和常遇春将张士诚围困在平江城后，方国珍又玩起了花样。他派人北上联络阔郭帖木儿，南下勾搭陈友定，约定一起对付朱元璋。但元朝末年，大局已定，方国珍错过了很多横扫江山的机会，坐看别人打架。现在已经无路可走，也算是“自掘坟墓”了。
张士诚兵败自尽后，方国珍不仅没有主动投降，反而将掠夺来的财宝运上大船，准备逃往大海。
当时，朱良祖攻占了方国珍的家乡泰州。唐和陆路南下，先后击溃了方国珍的步兵和骑兵，而廖永忠则率领水军，歼灭了方国珍的精锐水师。万般无奈之下，方国珍终于想到了求降，写了一封信给朱元璋一封诚恳的投降书：
“很遗憾，我多次背叛了你的信任，我作为一个庸人，从来不忍心称帝，只是想在乱世中求你，饶我一命。”
方国珍的态度可谓真诚，朱元璋也被他的真情所“打动”，在给方国珍的回信中坦言“往事已尽”。
1367年11月，方国珍来南京会见朱元璋。朱元璋的多疑和毒辣，他早就听说过，浑身颤抖，大气都不敢出。然而，即便如此乖巧，朱元璋还是骂了他一句：
“你现在投降是不是有点晚了？”
朱元璋三度安抚方国珍，方国珍放鸽子。他表面上听从朱元璋的话，暗地里却密谋阻挠朱元璋的统一大业。所以，朱元璋对他的怨恨也在情理之中。
朱元璋称帝后，将方国祯安置在广西，并特封他为广西左丞，边塞大臣，山高帝，充分满足了方国祯毕生的追求。但他多次以生病为由拒绝前往。就是被吏部官员催促，方国珍也宁愿躲在府中，也不愿去广西。最后，朱元璋给了他一个“吃不起粮饷的官”，让他领俸禄，但不用他去任。
纵观元末乱世英雄，韩山童被元兵所杀，徐寿辉内讧而死，陈友谅战败鄱阳湖而死，张士诚绝食而死，韩林纳被朱元璋淹死，只有方国珍躲过了元军，起义军内部的叛乱屠刀连朱元璋都没杀。
方国珍在朱元璋眼皮子底下，自有本事生存。他不愿去广西到任，就是为了斩断朱元璋的嫌疑。俗话说“大隐隐于朝”，朱元璋只有在身边才能最安全。而且他不结交达官贵人，不接见昔日部下，不参与政事，不给御史留下半点把柄。
方国珍死后，朱元璋亲自到方府吊唁。作为“反元首义人”，方国珍生前和死后的任性远超他的任何一位前辈。
